犬小孢子菌转录组测序分析及Zrta基因转化株的构建

来源 :西北农林科技大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:yingzi1100
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
犬小孢子菌(Microsporum Canis)是一种常见的人畜共患皮肤癣菌,主要感染皮肤、毛发和甲等角化组织,引起浅部真菌病。在真菌的生长和繁殖中,锌是一种必须微量元素,参与许多生物过程,对真菌的生长和代谢具有重要作用。在病原真菌与宿主相互作用过程中,宿主的营养免疫限制病原真菌对锌的摄取,为了能在锌限制条件下存活和增殖,病原真菌进化出特殊的锌稳态调控机制。锌响应激活蛋白(Zap1)及其同系物是调节锌稳态基因的主要转录因子,在酿酒酵母、烟曲霉、念珠菌等真菌中已被证实。但目前锌缺乏对犬小孢子菌基因表达的影响尚不清楚,关于犬小孢子菌锌响应激活蛋白参与的生物过程尚不明确。确定锌缺乏对犬小孢子的影响,明确锌响应转录激活因子在犬小孢子菌锌稳态调节中的作用,对犬小孢子菌锌稳态调控的相关研究具有重要意义。本试验通过对正常组(NORM)和锌限制条件下(Zn200和Zn800)生长的犬小孢子菌进行转录组测序,对所得数据进行的原始数据质控、比对分析、表达定量分析、差异表达分析、差异表达基因的功能富集和注释等,明确锌缺乏对犬小孢子菌基因表达的影响。通过根癌农杆菌介导的遗传转化(Agrobacterium tumefaciens-mediated transformation,ATMT)构建了犬小孢子菌锌响应转录激活因子Zrta基因缺失株,为后续Zrta基因功能分析奠定基础。研究结果如下;1.获得大量基因数据,差异表达基因数目统计显示,Zn800组和Zn200组与NORM组相比,上调基因分别为798、764个,下调基因分别为585、631个,其中MCYG04486、MCYG06235在锌限制组与正常组相比中均显著上调,MCYG02504只在Zn200中显著上调;Zn800组与Zn200组相比上下调基因的数目分别为3个和8个。差异表达基因功能注释分析表明MCYG06235(zinc-responsiveness transcriptional activator)可能为重要的锌转运因子。2.高保真扩增了犬小孢子菌锌响应转录激活因子基因MCYG06235(zinc-responsiveness transcriptional activator,Zrta),构建了含有Zrta基因两侧同源片段及潮霉素B抗性基因(hph)的双元载体pDHt/ZrtaⅠ、Ⅱ::hph,酶切和PCR验证证实双元载体构建成功。3.构建成功的双元载体转化入根癌农杆菌中,PCR结果验证转化成功后,用带有双元载体的根癌农杆菌转化犬小孢子菌,通过PCR和Southern blot对转化子进行鉴定,筛选出犬小孢子菌Zrta基因与潮霉素B抗性基因发生同源重组的菌株,获取的Zrta基因缺失株连续3次传代培养后,遗传性状稳定。本研究通过转录组测序明确了锌缺乏对犬小孢子菌基因表达和生物代谢等的影响,其中Zrta基因的基因注释结果表明其在锌代谢中可能起关键作用,成功构建了Zrta基因转化用的双元载体pDHt/ZrtaⅠ、Ⅱ::hph,通过ATMT成功获得犬小孢子菌Zrta基因缺失株,为Zrta基因的致病性和功能验证奠定了基础。
其他文献
“不当出生”之诉最早起源于英美法,此类案件指的是医疗机构在给孕妇进行产前检查过程中,因为医生履行不能或过失履行没有告知父母出生儿为缺陷儿的可能性,导致父母错过选择堕胎
双氧木脂素A(haedoxan A,HA)是从多年生草本植物透骨草(Phryma leptostachya L.)中分离鉴定的一种二氧双环辛烷木脂素类化合物,HA对多种害虫有效,尤其对家蝇和蚊子幼虫具有较高的杀虫活性。前期的症状学观察表明,供试昆虫经HA处理后肌肉松弛、虫体不自主震颤、出现麻醉现象并最终死亡,根据处理昆虫的中毒症状推测HA可能作用于昆虫的神经元或肌肉受体,但其具体的药物作用机制和靶
植物杂种优势的研究始于一百多年前,然而时至今日,杂种优势的遗传机制仍不明确,因此,选择两个优良品种的甘蓝F_1代及其双亲,调查统计9个与叶球相关的园艺学性状,计算中亲优势和超亲优势,同时,取各甘蓝部分结球叶片进行转录组测序分析,比对不同组合的双亲与杂种之间的差异表达基因(DEGs),探讨差异表达基因富集的主要生物学功能和代谢通路,此外,对杂种中基因表达模式进行划分并分析调控杂种内基因表达的顺式和反
<正>提起通俗音乐,好像明白如水,细一思考,竟有不尽的思绪,谈不完的话题。大众的、普通流行的音乐,是被称为"通俗音乐"的一类音乐。这类音乐有群众当靠山,基础深厚,拥有的听
期刊
湖湘文化所蕴含的优良品质对于塑造湘商具有重要的借鉴价值:"心怀天下、忧国忧民"是湘商应有的爱国精神";坚韧执著、百折不挠"是湘商应有的进取精神;"革故鼎新、敢为人先"是
通过将苯乙烯-丙烯腈共聚物(SAN)与不同含有聚丁二烯橡胶成分的丙烯腈-丁二烯-苯乙烯共聚物(ABS)抗冲改性剂共混挤出,制备了一系列不同橡胶组成的ABS材料。系统研究了橡胶含
曾几,我国南北宋之交著名诗人,可谓江西诗派的“后起之秀”。21世纪,学界在曾几研究原有的基础上不断开拓学术视野、扩大研究范围,研究角度、方法也更加多样,曾几研究呈逐渐深化
小麦(Triticum aestivum L.)是我国最重要的粮食作物之一。提高产量一直是小麦育种工作的主要目标。小麦穗部性状对其产量起决定性作用,而在转录组水平对小麦穗部基因大范围表达谱的研究尚不深入。六倍体小麦基因组序列的发布为小麦转录组的研究提供了坚实的基础。基于小麦精细基因组图谱进行转录组图谱的研究,从而筛选和穗部发育相关的基因,对小麦相关分子育种是极其重要的。除了转录调控外,可变剪接(A
随着全球经济一体化的日益发展,制造企业之间的竞争程度愈渐激烈,消费需求呈现出个性化、多样化的趋势,服务化已成为发达国家制造业增长的关键,制造业和服务业出现互动融合、相互