新疆南疆地区部分规模化场绵羊毕氏肠微孢子虫PCR检测与亚型鉴定

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毕氏肠微孢子虫是一种胞内寄生的真核单细胞微生物,宿主范围广泛。研究发现,不同国家和地区的羊普遍感染毕氏肠微孢子虫,其基因型具有遗传多样性和宿主适应性特点。本研究采用PCR法检测新疆南疆部分规模化场绵羊毕氏肠微孢子虫的感染情况,通过序列分析与对比,鉴定毕氏肠微孢子虫的基因型/亚型,解析其遗传多样性。1.收集新疆南疆3个地区7个规模化场绵羊粪便样本892份,基于毕氏肠微孢子虫ITS基因,采用PCR法检测绵羊粪便DNA样本,309份呈毕氏肠微孢子虫阳性,总感染率为34.6%(309/892)。7个养殖场均检测到毕氏肠微孢子虫阳性,以库车市养殖场绵羊毕氏肠微孢子虫感染率最高,为57.1%(60/105),不同养殖场绵羊毕氏肠微孢子虫的感染率差异极显著(P<0.01)。以3-6月龄断奶后羔羊毕氏肠微孢子虫感染率最高,为43.1%(103/239),成年羊、3月龄以下断奶前羔羊、6-12月龄育肥羊毕氏肠微孢子虫感染率分别为20.5%(42/205)、35.5%(75/211)、21.5%(51/237),不同年龄段绵羊毕氏肠微孢子虫的感染率统计学差异极显著(P<0.01)。经序列比对分析,鉴定出6个已知毕氏肠微孢子虫基因型,其中BEB6占所有基因型的93.5%(289/309),其余基因型为基因型COS-I(n=9)、CHS3(n=5)、NESH4(n=2)、CHC8(n=3)和CHS5(n=1)。种系发育分析显示,基因型CHS5属于第1组群,其余5个基因型属于第2组群。研究结果显示,在新疆南疆规模化羊场羊普遍感染毕氏肠微孢子虫,以基因型BEB6为优势基因型。2.根据不同养殖场和不同年龄段分布,自289份呈毕氏肠微孢子虫基因型BEB6阳性的样本中挑选出80份样本,分别基于毕氏肠微孢子虫MS1、MS3、MS4、MS7基因位点进行PCR扩增。在MS1和MS7基因位点,80份样本成功扩增出34个和31个样本,有17个样本在两个位点同时扩增出来;在MS3、MS4基因位点,均未扩增出目的条带。经序列分析比对,34条MS1基因序列存在20个基因亚型,31条MS7基因序列存在3个基因亚型。研究结果提示新疆南疆地区羊毕氏肠微孢子虫基因型BEB6存在遗传多样分化特点。综上所述,结果发现新疆南疆地区规模化场绵羊普遍感染毕氏肠微孢子虫,以基因型BEB6为优势基因型,其基因亚型存在多样分化特点。研究结果为我国羊源毕氏肠微孢子虫的病原学和分子遗传特征的研究提供了基础参考资料。
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