论文部分内容阅读
鳡鱼（Elopichthys bambusa）是一种大型的淡水凶猛鱼类，其肉质鲜美，被视为高档淡水鱼类，充分认识鳡鱼的种群遗传结构和遗传多样性水平，对其种质资源的评价、保护和持续利用具有重要意义。本文采用ISSR分子标记技术，对丹江口水库鳡鱼野生群体和养殖群体的遗传多样性进行分析研究，研究结果如下：（1）利用正交实验设计的方法，对鱤鱼ISSR-PCR反应体系中的Mg2+浓度、引物浓度、dNTPs浓度、DNA模板浓度及Taq DNA聚合酶浓度进行优化分析。建立了最佳ISSR-PCR反应体系，即25μl反应体系中含Mg2+2mmol/L、引物0.4μmol/L、dNTPs0.2mmol/L、模板DNA100ng(25μl)、Taq DNA聚合酶1.0U。并在此基础上对退火温度和循环次数进行了梯度试验，得到最佳退火温度为52℃，最佳循环次数为35次。（2）筛选出18个ISSR引物，对丹江口水库野生和养殖2个鳡鱼群体（共60尾）的基因组DNA进行PCR扩增，共检测到148个位点，多态位点58个，多态性比例为39.19%。利用POPGENE软件分析2个鳡鱼群体的多态位点比例（PPB）为29.05%和27.70%，观测等位基因数（Na）为1.2905和1.2770，有效等位基因数（Ne）为1.1489和1.1490，Nei’s基因多样度（h）为0.0906和0.0901，Shannon’s信息指数（I）为0.1388和0.1372，遗传距离（D）为0.1031和0.1079。两群体所有遗传多样性指标综合显示，丹江口水库鳡鱼野生群体的遗传多样性略高于养殖群体的遗传多样性。（3）根据Shannon’s信息指数分析鳡鱼遗传变异来源，有76.46%的变异来自群体内，23.54%的变异存在于群体间。由AMOVA分析其变异来源有55.51%存在于在群体内，44.49%存在于群体间。两种方法的结果都表明，鳡鱼群体内的变异大于群体间的变异。由POPGENE软件在Nei’s基因多样性的基础上计算鳡鱼群体间遗传分化系数Gst为0.3608，AMOVA分析显示其的遗传分化系数Φst为0.4449，两种结果都说明鳡鱼群体间有较大的遗传分化。由Gst计算的种群间基因流（Nm）为1.1297，基因流水平较高。