为明确贮藏年限对燕麦种子种带真菌和真菌毒素的影响,本研究以6个燕麦品种（裸燕麦白燕2号、坝莜9号和坝莜14号,皮燕麦陇燕2号、坝燕4号和白燕7号）为供试材料,通过平板培养法、形态学鉴定法及rDNA-ITS序列分析法对其携带的真菌进行培养后做分离和鉴定;通过高效液相色谱质谱联用法对种子中检测出的优势菌属产生的毒性较强的细交链格孢酮酸（TeA）、黄曲霉毒素B₁（AFB₁）和桔青霉素（CIT）进行了检测和分析,获得如下主要结果:（1）贮藏年限是引起燕麦种子带菌量、带菌种类和分离率差异的主要因素。带菌量随贮藏年限的延长总体呈降低趋势,其中孢子负荷量的变幅较大,介于0.33 cfu²9.70 cfu之间,各品种的孢子负荷量变化较大、差异显著。带菌率变化范围为1.50%³6.75%,各品种在贮藏1年或2年时的带菌率达到峰值,随后显著下降,除陇燕2号在贮藏3年时带菌率最低外,其他材料均在贮藏5年时达到最低值。带菌种类和分离率随贮藏年限的变化也具有显著差异,不同品种的带菌情况也差异显著,带菌量和带菌种类的多少无明显相关性。白燕2号的总体带菌量最低,坝莜14号带菌种类最多,坝燕4号带菌种类最少但带菌量最高。（2）从燕麦种子中共检出真菌20属45种,优势属为链格孢菌属、曲霉菌属和青霉菌属,优势种因贮藏时间和品种而异。（3）品种、贮藏年限及二者的互作对燕麦种子TeA、AFB₁和CIT的检出量都有极显著影响,其中贮藏年限和品种的互作对毒素含量的影响最大。燕麦种子中最主要的真菌毒素是TeA,其变幅为16.88 ug/kg³48.67 ug/kg;CIT次之,变化范围为0.02 ug/kg⁷.06ug/kg;AFB1的含量最低,含量为0.01 ug/kg¹.04 ug/kg。3种真菌毒素随贮藏年限的延长基本呈先升后降的趋势,其含量多在贮藏2年或3年时达到峰值,随后下降。（4）燕麦种子的带菌量和真菌毒素含量无显著相关性。与皮燕麦相比,裸燕麦种子总体的带菌量、带菌种类和毒素检出量都较低。皮燕麦种子外部的平均孢子负荷量为3.69 cfu,种子内部的平均带菌率为8.83%;裸燕麦种子的平均孢子负荷量和带菌率分别为2.69 cfu和9.67%。从不同贮藏年限的皮燕麦和裸燕麦种子中分别检出17属37种和17属33种真菌,其中仅存在于皮燕麦种子的有8属12种,仅在裸燕麦中检出的有8属8种。不同贮藏年限皮燕麦种子的TeA、AFB₁和CIT平均含量分别为140.70 ug/kg、0.18 ug/kg和2.74 ug/kg,而裸燕麦种子中其含量分别为123.85 ug/kg、0.23 ug/kg和0.84 ug/kg。