【摘 要】
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信息学和统计学方法可以有效地组织和管理越来越庞大的化学和生物活性数据库,从而更好地将其应用药物设计中去.因此,CADD已被公认为是一种高效的药物设计手段,在该论文中,我
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信息学和统计学方法可以有效地组织和管理越来越庞大的化学和生物活性数据库,从而更好地将其应用药物设计中去.因此,CADD已被公认为是一种高效的药物设计手段,在该论文中,我们对两类重要的药物作用靶标,即PPARγ和MMP进行了这方面的研究.过氧化物酶体增殖剂活化受体γ(PPARγ)是一个由配体激活的核转录因子,属于核激素受体(Nuclear hormone receptor)超家族.被激动剂激活以后,该受体可以促进葡萄糖的利用以及胰岛素的增敏.因此,PPARγ激动剂有希望成为一类全新的Ⅱ型糖尿病治疗药物.我们利用疏水性分析和分子对接方法对18个重要的激动剂和PPARγ之间的分子识别进行了研究.研究表明分子对接程序FlexX预测的激动剂结合构象非常接近晶体结构,此外,激动剂FlexX的打分和实际激动活性之间也有较好的相关性,这说明对于PPARγ,FlexX程序是一个比较合适的分子对接研究方法.利用FlexX,我们得到了这18个激动剂的结合构象和药效基团,并利用FlexX的打分函数解释了这些化合物活性上的存在的差异.
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