羊驼（Vicugna pacos），属哺乳纲，偶蹄目，主要分布于南美洲秘鲁、玻利维亚和智利的安第斯山脉和阿尔卑斯山脉等高地国家。羊驼绒毛被称为软黄金，是高档纺织品原材料，同时羊驼肉、羊驼奶都有很高的价值。总的来说羊驼是一种毛肉兼用型、高经济价值的特种动物，可以带动当地旅游业的发展。我国于2002 年由董常生从澳大利亚引进羊驼进行研究，并成立中华羊驼基地。近些年来我国羊驼产业逐步发展，慢慢变成我国特种饲养的新兴支柱产业之一。肠道微生物菌群与宿主健康息息相关，它对宿主食物的消化、本身的代谢、抵御致病菌的入侵等起着不可替代的作用。本文以羊驼粪便为材料，研究了羊驼肠道菌群构成，并对比了不同生长期及不同生理时期羊驼肠道菌群的差异，主要研究结果如下：　　基于16S rDNA的 V3-V4区高通量测序方法分析羊驼肠道菌群结构及多样性特点，结果显示，羊驼肠道菌群组成上分布最多的是厚壁菌门（ Firmicutes ），其次是拟杆菌门（Bacteroidete），疣微菌门（verrucomicrobia），变形菌门（Proteobacteria），小羊驼相较成年羊驼，变形菌门（Proteobacteria），疣微菌门（verrucomicrobia），拟杆菌门（Bacteroidete）这三种细菌所占比例高。小羊驼和成年羊驼肠道菌群在属水平分类上有显著差异，小羊驼的前五种主要细菌为嗜黏蛋白阿克曼氏菌属（ Akkermansia ），大肠杆菌志贺氏菌属（Escherichia/Shigella），梭状芽胞杆菌属XIVa（Clostridium XlVa），摩根菌属（Morganella），布劳特氏菌属（Blautia），而成年羊驼的菌群组成则相对稳定，与性别、是否怀孕相关性不大。　　运用特异性引物检测羊驼肠道拟杆菌、梭菌、韦荣球菌、双歧杆菌、乳酸杆菌、大肠杆菌、肠球菌 7种细菌，发现1d 的羊驼肠道没有这7 种菌，7 d 和14 d有亮度很低的拟杆菌、梭菌和肠球菌特异性引物的扩增条带，2 1d和2 8d可以检测到全部7 种细菌的存在。　　实时荧光定量PCR检测不同生长阶段及生理时期羊驼肠道肠球菌、梭菌和拟杆菌结果显示，幼驼肠道中梭菌含量比公羊驼、空怀羊驼、妊娠羊驼低，差异达到极显著水平（P<0.01），妊娠羊驼肠道中的拟杆菌含量高于公羊驼和空怀羊驼（P<0.05）。28 日龄内，随着羊驼日龄增长，羊驼肠道肠球菌、梭菌和拟杆菌含量升高。28 日龄内，同一日龄羊驼肠道菌群存在差异，幼驼7d 时，肠道梭菌含量低于肠球菌和拟杆菌（P<0.05），肠球菌和拟杆菌差异不显著；14d 时，肠球菌含量极显著高于梭菌（P<0.01），拟杆菌含量显著高于梭菌（P<0.05），肠球菌和拟杆菌差异不显著；21d 时，肠球菌含量极显著高于梭菌和拟杆菌（P<0. 01），拟杆菌含量高于梭菌，达到显著水平（P<0.05）；28d时，肠道中肠球菌高于梭菌、拟杆菌，差异达到极显著水平（P<0.01），拟杆菌和梭菌相比差异不显著。