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我国肝癌5年生存率为10%-13%仅稍高于胰腺癌,肝细胞癌（hepatocellular carcinoma,HCC）作为原发性肝癌（primary liver cancer,PLC）最主要病理类型,约占PLC的75%-85%,而位居第二的胆管细胞癌（cholangiocarcinoma,CHOL）约占10%-15%[1]。随着免疫治疗开启了肿瘤治疗的新纪元,寻找HCC治疗新靶点和预后标志物变得尤为重要。在肝癌精准治疗中,从分子层面上探讨以上两大病理亚型的发病机制,对于帮助HCC早诊早治及评估生存预后具有重要意义。乙型肝炎病毒（hepatitis B virus,HBV）作为世界范围的公共卫生问题被认为是导致HCC最常见的病因之一,HBV相关性HCC的发生机制以及所富集的信号通路尚不明确。然而,微糖核苷酸（micro-ribonucleic acids,mi RNAs）作为单链非编码小分子RNAs与肿瘤的发生发展密切相关,已有文献提出mi RNAs失调是HCC的一个特征。基于以上研究背景,我们首先收集了在临床治疗过程中,接受免疫治疗晚期HCC患者的临床病例资料,试图寻找具有潜在预后价值的系统炎性标志物并加以验证。同时借助生物信息学分析,寻找潜在靶点及其相关信号通路,全面探索肝癌发生发展机制的基因调控网络,为下一步开展基础研究提供思路。第一部分关于抗PD-1治疗晚期HCC患者的真实世界研究目的:为接受抗PD-1治疗晚期HCC患者提供更多临床证据,同时,试图阐明系统炎症标志物在免疫治疗患者中的预后价值。方法:通过回顾性分析接受抗PD-1治疗晚期HCC患者的临床资料来评价真实世界中免疫治疗的有效性和安全性,同时明确系统炎症标志物是否可以作为这部分患者潜在的预后指标。结果:65例患者中位PFS为7.3个月（95%CI 5.61-8.99）,中位OS为18.5个月（95%CI 11.71-25.29）,DCR为75.38%,ORR为43.07%。亚组分析结果显示联合用药组疗效优于单药组。此外,本研究表明高PNI（截断值为44.17）是接受抗PD-1的晚期HCC患者的预后保护因素。结论:抗PD-1治疗（尤其是联合治疗）为晚期HCC有效且相对安全的方案。同时,PNI可以作为接受免疫治疗患者有效的预后指标。第二部分免疫联合抗血管治疗晚期HCC患者预后标志物的筛选与验证目的:探讨病理指标中磷脂酰肌醇蛋白多糖-3（Glypican-3,GPC3）、KI67以及外周血中的CRP,在免疫联合抗血管的晚期HCC患者生存预后中的价值,同时验证PNI在免疫联合抗血管治疗中的预后能力。方法:首先通过生物学信息分析TCGA数据库中GPC3在不同癌症中的表达量,然后,回顾性分析接受抗PD-1联合抗血管治疗晚期HCC患者的临床资料。根据Kaplan-Meier方法描述,系统炎性PNI、CRP和免疫组化中GPC3、KI67在免疫联合治疗晚期HCC患者生存预后的价值。结果:PNI可作为抗PD-1免疫联合抗血管治疗晚期HCC患者的良好预后指标。高PNI（＞44.17）和低CRP（=＜0.8）预示着这部分患者有较好的预后。GPC3+和高KI67（＞50%）在免疫联合抗血管治疗晚期HCC患者中可能与不良预后相关。结论:抗PD-1联合抗血管治疗晚期HCC患者的回顾性分析提示,系统炎性标志物PNI和CRP是评估晚期HCC预后的良好指标。第三部分筛选和鉴定肝细胞癌与胆管细胞癌之间的关键基因目的:本研究旨在通过生物信息学分析筛选和鉴定HCC与CHOL之间的差异表达基因（differentially expressed genes,DEGs）,为这两种病理分型的细胞起源和鉴别诊断提供了新的视角。方法:对鉴定出的DEGs进行功能注释、通路富集分析,利用GEPIA数据库比较鉴定出的HCC/CHOL与正常组织之间的基因表达和生存分析。结果:（1）在HCC和CHOL之间共鉴定出171个DEGs以及10个枢纽基因。（2）ITIH2和APOA2是帮助鉴别HCC和CHOL的关键基因,并且在HCC患者中ITIH2高表达与良好生存预后相关。结论:本研究鉴定出171个DEGs和10个枢纽基因帮助我们了解HCC和CHOL的分子机制,其中ITIH2和APOA2为两者之间的鉴别诊断提供了潜在靶点。此外,ITIH2表达量与HCC患者预后密切相关。第四部分慢性乙肝与HBV相关性肝细胞癌之间mi RNAs-m RNAs调控网络的鉴定目的:探究HBV相关性HCC发生过程中mi RNAs-m RNAs调控网络的改变。方法:筛选出慢性乙肝与HBV相关性HCC之间的DE-mi RNAs,探究潜在的mi RNAs-m RNAs调控网络在HCC中的功能富集和通路分析,使用Kaplan-Meier plotter数据库进一步评估筛选的DE-mi RNAs在HCC中的预后作用。结果:（1）通过使用生物信息学分析,HBV相关性HCC与慢性乙肝之间鉴定出45个DE-mi RNAs,其中包括24个上调的DE-mi RNAs和21个下调的DE-mi RNAs。（2）hsa-mi R-21调控的CDC42,VEGFA和hsa-let-7f-1调控的HNRNPM,GSK3β,HNRNPU,SMAD2所构成的mi RNAs-m RNAs调控网络可能在促进慢性乙肝向HBV相关性HCC的发生和进展中起着重要作用。此外,hsa-mi R-21的上调和hsa-let-7f-1的下调预示着HCC有较差的预后。结论:失调的has-mi R-21和has-let-7f-1及其对应的靶基因所构成的mi RNAs-m RNAs调控网络,可能为HBV相关性HCC提供潜在靶点和预后指标。has-mi R-21上调和has-let-7f-1下调可能导致HCC预后不良。