基于Vif-APOBEC3G轴的相互作用网络分析及相关蛋白的表达

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载脂蛋白B mRNA编辑酶催化多肽样蛋白3G(apolipoprotein B mRNAediting catalytic polypeptide3G, APOBEC3G)作为机体内在抗HIV-1因子,与HIV-1的Gag蛋白相互作用,被选择性包装入毒粒中。在HIV-1的逆转录过程中,APOBEC3G催化病毒负链DNA中的dC脱氨为dU,进而降低病毒的感染力。但HIV-1病毒感染因子(virion infectivity factor, Vif)可结合APOBEC3G,在核心结合因子β (core binding factor β, CBF-β)参与下,激活泛素-蛋白酶体途径,使之降解,拮抗其抗HIV-1活性。因此,以HIV-1Vif、CBF-β等为靶点,开发阻止或减少APOBEC3G降解的药物是抗HIV-1药物研究的新方向。本课题采用Cytoscape软件,以参与Vif介导APOBEC3G降解的六种蛋白(APOBEC3G、Vif、CBF-β、CUL5、TCEB2、TCEB1)为中心,构建了基于Vif-APOBEC3G轴的相互作用网络。在该网络中有534个节点,679条边;网络的聚集系数为0.165,平均路径长度为2.343。利用MCODE插件预测出六种关联积分值大于等于1的复合体。在课题组前期工作基础上,本课题又构建了pFC-APOBEC3G、pFC-Vif、pFC-CBF-β、pEGFP-CBF-β真核表达载体。利用Confocal技术检测到CBF-β融合蛋白在胞浆及胞核均有分布。Western Blot显示Vif与APOBEC3G共转染时,Vif可明显降低APOBEC3G的表达;Vif、CBF-β与APOBEC3G三者共转染时,几乎检测不到APOBEC3G特异性条带。
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