近年来,随着生态环境破坏和环境污染越来越严重,环境保护成为世界的焦点。环境监测是环保工作的基础,承担着环保监测职能的环保监测中心也备受瞩目。一方面,国家财政对于污染源普查专项资金投入逐年加大,对单位的内部管理提出了挑战。另一方面,随着收入支出的复杂化,在内部管理中的不足也逐渐暴露出,这严重阻碍着环境监测中心的健康良性发展,为了解决内部管理中的问题,完善内部审计工作迫在眉睫。A市生态环境监测中心是国家设置的带有一定公益性质的社会组织,代表着国家的利益,其内部管理水平的高低,关系着是否能够履行好国家赋予的职责和守护好国家公共财产。2018年3月,审计署发布《审计署关于内部审计工作的规定》明确提出,“对本单位及所属单位的自然资源资产管理和生态环境保护责任的履行情况进行审计,是国家机关、事业单位、社会团体等单位的内部审计机构或者履行内部审计职责的内设机构必须认真履行的一项重要职责”。在这种大环境下,单位内部开展审计工作,可以促进内部管理规范化、风险防控常态化、经济决策科学化。此外,在当前反腐形势严峻,全民倡导节俭之风的社会风气下,完善内部审计可以推进党风廉政建设、营造良好“政治生态”。本文主要借鉴委托代理理论,以A市生态环境监测中心为研究对象。首先采用文献研究法,对国内外学者的研究成果进行整理和分析,为研究奠定理论基础;其次采用案例分析法,通过深入了解并研究A市生态环境监测中心内部审计工作现状;最后结合相关理论探究单位内部审计实施中存在的问题与不足,具体表现在以下几个方面:单位内审制度不完善;单位上下对内审工作缺乏重视;内审机构和人员不独立;审计内容和范围受限;传统审计方法限制了审计职能的发挥以及后续跟踪流程执行不到位。针对这些问题进行深入思考,进而提出了相对应的优化措施:健全单位内部审计制度;强化对内审工作的认识;增强机构和人员的独立性;改进工作方式方法;拓宽内部审计工作范围,充分发挥内部审计职能;加强对结果的监督运用等。在当前大环境下,本文通过对A市生态环境监测内部审计实例进行研究,一方面可以及时对审计开展过程中的风险加以应对,提升工作的效率和效果;另一方面,可以为生态环境系统内其他单位内部审计工作的完善提供参考意义。