脂蛋白是血液中一类由蛋白质、胆固醇和甘油三酯组成的球状微粒,按照密度由高到低可以分为：高密度脂蛋白、低密度脂蛋白、中间密度脂蛋白、极低密度脂蛋白和乳糜微粒,对于细胞外脂质的包装、储存、运输和代谢起着重要作用,脂蛋白代谢异常与动脉硬化症、二型糖尿病、肥胖症以及肿瘤发生密切相关。高密度脂蛋白在所有脂蛋白中直径最小、密度最大,且高密度脂蛋白胆固醇(HDL-C)在临床研究中常被称为“好胆固醇”,与心血管疾病风险呈负相关。近年有研究表明,高密度脂蛋白功能的丧失或转变为促炎症高密度脂蛋白与二型糖尿病和冠状动脉疾病发生与发展有着密切联系。为进一步研究高密度脂蛋白功能的改变,本研究首先对血浆中的高密度脂蛋白的分离和纯化进行方法学研究,通过颗粒直径和均一度两个指标对高密度脂蛋白的纯度进行验证,并获得纯度较高的高密度脂蛋白,并将该方法应用于二型糖尿病与冠状动脉疾病高密度脂蛋白质组学研究。本研究选取健康对照组、二型糖尿病组、冠状动脉疾病组和二型糖尿病合并冠状动脉疾病组四类人群,通过高密度脂蛋白的分离和纯化,以及基于液相色谱串联质谱和非标定量的蛋白质组学方法,对这四类人群的高密度脂蛋白质组进行定量比较,共鉴定到105种蛋白质,其中72种蛋白质在四组实验中均被鉴定到,33种蛋白质在各实验组间存在高表达或低表达。通过蛋白质-蛋白质相互作用、蛋白质功能注释和功能富集等相关的生物信息学技术及相关统计学方法,这些高表达或低表达蛋白质主要具有血管收缩、内皮细胞损伤、血栓形成和炎症响应等生物学功能,且存在8种不同的表达模式。这些结果对寻找高密度脂蛋白功能丧失和促炎症性发生和发展过程中的关键蛋白质,及对二型糖尿病和冠状动脉疾病的预防、诊断和治疗具有重要的意义。