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目的:翘嘴鳜是我国重要的水产养殖品种之一。但是,该鱼极易受到传染性脾肾坏死病毒(Infectionspleenandkidneynecrosisvirus,ISKNV)的感染且发病率和致死率都很高,目前尚无有效的防治措施。因此,亟待通过其抗病机制的研究来寻找解决方案。干扰素调节因子7(Interferonregulatoryfactor-7,IRF-7)是在B细胞、脾脏、胸腺和外周血淋巴细胞中的单核细胞中表达的基因,在启动IFN-I的中起到关键作用,在人类等高等生物的机体抗病毒等免疫反应过程中发挥重要作用。本文研究翘嘴鳜受到ISKNV刺激后其主要免疫组织ScIRF-7基因和IFN-α3基因表达的响应情况以及ScIRF-7活性蛋白刺激对其存活率、脾脏组织ScIRF-7和IFN-α3基因表达及ScIRF-7蛋白表达的影响,从而从基因和蛋白响应层面来初步探究ScIRF-7在翘嘴鳜抗ISKNV中的免疫功能;另外,在翘嘴鳜对ISKNV的抗性群体和易感群体中筛选并验证与ISKNV抗性关联的ScIRF-7的SNPs位点,以期为ScIRF-7抗ISKNV功能的深入研究提供一定的参考,并为翘嘴鳜选择育种提供潜在的分子标记。方法:(1)利用全长转录组获得的结果,在NCBI上进行序列比对,最终确定ScIRF-7的cDNA序列;利用NetPhos 3.1在线软件预测ScIRF-7蛋白磷酸化位点;利用Clustal Omega在线软件进行同源性比对,用T-Coffee生成氨基酸多序列比对文件,采用MEGA6.0软件并用最大似然法(ML)法构建系统进化树;利用NetNGlyc1.0在线软件预测ScIRF-7蛋白糖基化位点。(2)采用qPCR法检测翘嘴鳜被腹腔注射ISKNV后的不同时间(hpi,hours post-infection)其脾脏、体肾、肝脏和肠道组织中ScIRF-7以及IFN-α3mRNA的相对表达水平。(3)构建原核表达载体体外诱导ScIRF-7重组蛋白。(4)利用ScIRF-7活性蛋白以及ScIRF-7-KLH免疫新西兰大白兔制备多克隆抗体。(5)设计PBS组(对照组)、ISKNV组以及不同浓度的ScIRF-7活性蛋白+ISKNV组,统计各组存活率,利用qPCR检测ScIRF-7 mRNA在各组脾脏、体肾、肝脏以及肠道组织中的表达情况,利用免疫组化技术检测IRF-7蛋白在各组脾脏组织的表达情况。(6)在对ISKNV抗性和易感的2个翘嘴鳜群体中,首先各随机选取10尾,用直接测序法筛选获得与ISKNV抗性关联的ScIRF-7候选SNPs位点,然后各随机选取150尾,利用KASP基因分型技术验证这些SNPs位点与ISKNV抗性的显著相关性。结果:(1)ScIRF-7基因cDNA包含一个1368bp的开放阅读框(ORF),蛋白分子量为50.24 kDa,同源性分析显示,翘嘴鳜与鲈形目如大口黑鲈、白梭吻鲈等亲缘关系最为接近,与哺乳类以及鸟类的亲缘性较远。ScIRF-7蛋白含有IRF和IRF3结构域,含有18个Ser磷酸化位点、12个Thr磷酸化位点以及12个Tyr磷酸化位点,此外有一个糖基化位点(第399位氨基酸)。(2)ScIRF-7mRNA在健康翘嘴鳜10种组织中广泛表达,其中在体肾、鳃和脾脏等免疫组织中较为显著。翘嘴鳜经腹腔注射ISKNV后的168h内,其肝脏、肠道、脾脏和体肾中的ScIRF-7mRNA的表达量都有不同程度的上升;其中:在肝脏中,自6h起ScIRF-7mRNA显著上调(P<0.05),至72 h达到最高(P<0.001);在体肾中,自3h起显著上调(P<0.05),直至168h到达峰值(P<0.001);在脾脏和肠道中,在3h出现峰值(P<0.001),并在168h显著上调(P<0.01);IFN-α3 mRNA的表达量与ScIRF-7存在较显著的相关性,其中在脾脏和肠道中的显著响应的时间点均与ScIRF-7比较同步,而在体肾和肝脏中的显著响应时间分别晚于ScIRF-7 18 h和42 h。(3)ScIRF-7重组蛋白大小为50.24 kDa,ELISA结果显示,以活性蛋白和小肽为抗原获得的ScIRF-7多克隆抗体效价分别为1:16000和1:64000;Western Blot结果显示,制备的多克隆抗体可特异性识别ScIRF-7重组蛋白;间接免疫荧光实验结果显示翘嘴鳜原代肝细胞中的ScIRF-7蛋白主要存在于细胞质中。(4)为期7 d的实验表明,腹腔注射ScIRF-7活性蛋白(100 μg)能显著降低ISKNV感染对翘嘴鳜死亡率的影响,ISKNV组和ISKNV+50 μg活性蛋白组的脾脏和体肾中ScIRF-7和IFN-α3 mRNA表达量均有不同程度的显著上调,而ISKNV+100μg活性蛋白组的肝脏中这2个基因的表达水平无显著变化;免疫组化结果显示:ScIRF-7蛋白在翘嘴鱖脾脏组织中的表达量与被感染ISKNV的翘嘴鳜的死亡率呈负相关。(5)在ScIRF-7基因中鉴定出5个SNP位点,分别位于外显子的355(C/G)、1322(G/A)、1563(A/C)、1743(T/A)和 1918(C/T),其中,1743(A/T)和 1918(C/T)位点的基因型分布和等位基因频率在ISKNV抗性群体和敏感群体之间分别存在极显著差异(P<0.01)和显著差异(P<0.05)。结论:经ISKNV感染诱导后,翘嘴鳜肝脏、肠道、脾脏和体肾中ScIRF-7及IFN-α3的mRNA表达量有不同程度的上调,这表明ScIRF-7基因可能在受到ISKNV刺激的翘嘴鳜所产生的免疫进程中发挥重要作用。ScIRF-7蛋白主要分布于免疫组织的细胞质中,腹腔注射ScIRF-7活性蛋白可提高翘嘴鳜免疫组织ScIRF-7的含量并降低感染ISKNV的死亡率。另外,在ScIRF-7的cDNAs序列中筛选到5个SNPs标记,其中1743(A/T)和1918(C/T)位点与ISKNV抗性显著相关。