应用基因芯片技术比较研究初治与复发急性淋巴细胞白血病基因的差异表达

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目的为探讨初治与复发急性淋巴细胞白血病(ALL)的相关基因差异表达,本文应用基因芯片技术对ALL 初治和复发时的基因表达谱进行比较、分析、筛选,以较全面、深入地了解急淋相关基因或复发相关基因的表达变化。方法收集5 对急性淋巴细胞白血病患者初治和复发时的外周血或骨髓标本,分离出单个核细胞,提取总RNA。将等量的实验组(复发组)和对照组(初治组)RNA 逆转录合成荧光分子标记的cDNA 作为探针,其中Cy3 标记对照组,Cy5 标记实验组,混合后与4096 点的BioStar H-40s 型基因表达谱芯片杂交。严格洗片后用ScanArray4000 扫描仪扫描芯片的荧光信号图像,计算机分析比较差异表达基因。将83 例急性淋巴细胞白血病患者按病程分为初治组和复发组,以36 例异基因干细胞移植患者的健康供者及健康体检者作为正常对照,用半定量RT-PCR 方法检测其中某些差异表达基因在急淋患者及正常对照组中的表达,采用SPSS11.5 软件分析统计结果。结果通过基因芯片技术筛查出在4 对以上标本中共同差异表达的基因共27个,其中上调基因9 个(0.220%),归为免疫相关、细胞信号和传递蛋白、蛋白翻译合成、代谢、细胞骨架和运动、原癌基因和抑癌基因等;下调基因18 个(0.439%),归为免疫相关、细胞信号和传递蛋白基因、细胞骨架和运动、DNA 合成和修复、重组蛋白、蛋白翻译合成、细胞周期蛋白基因、免疫相关等基因。选择其中差异表达基因DAXX、TM4SF-13 及BRD-2 经半定量RT-PCR 验证后发现,DAXX 和TM4SF-13 基因在复发组表达水平有低于初治组的趋势,与芯片结果相吻合,但经统计学分析,表达量的差别无显著意义;这两个基因在正常对照组
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