本文将Granger因果模型应用到功能磁共振数据(fMRI)，考察不同脑区之间的有效连接。 首先，对Granger因果模型的基本理论进行回顾，介绍了Granger因果模型建模方法、模型定阶方法、模型参数估计方法以及统计检验方法。从功能磁共振数据成像的原理可知，血氧水平依赖信号(BOLD)是缓慢变化，这样fMRI数据可以认为是近似平稳信号。因此，将Granger因果模型应用于模拟fMRI时间序列时采用时不变因果模型，利用Akaike信息量准则和贝叶斯信息量准则得到适用于fMRI数据的经验阶数；在此基础上，利用最小二乘法和逐步最小平方法对模型进行参数估计，经过讨论发现最小二乘法比逐步最小平方法更适用应用到fMRI数据。最后，应用一种改进的统计检验方法——替代数据检验方法对Granger因果值的可靠性进行检验。 将上面研究方法应用到实际获得的动手指实验fMRI数据，对激活脑区左侧SMA和左侧SMC进行因果检验，结果表明左侧SMA对左侧SMC有因果作用。这与已有文献中的结论基本一致，进一步证明对fMRI数据可以建立其时不变Granger因果模型，并且经验阶数和改进的替代数据检验方法也适用于fMRI数据。