转基因水稻PA110-15品系特异性检测方法的建立

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随着全球转基因产品的日益增多,以及越来越多的转基因作物品系获得商品化生产,品系特异性检测己成为国际上转基因成分检测的重要方法。随着技术的不断发展和进步,转基因食品的检测技术也在向着快速、精确、高通量的检测方向发展。基于核酸特异性检测,现已有四种方法,分别是通用元件的筛选检测、外源特异性基因检测、构建特异性检测和品系特异性检测,其特异性强度依次增加,品系特异性检测的特异性最高。目前检测转基因品系特异性的主要方法有普通PCR、实时荧光定量PCR和环介导等温扩增(Loop-mediated Isothermal Amplification,LAMP)法,他们各有优缺点。转基因水稻PA110-15是通过农杆菌转化获得的含有高赖氨酸储藏蛋白基因的水稻品种,目前尚未获得我国农业部颁发的安全证书。为更好地监测转基因水稻PA110-15品系的存在,我们有必要建立品系特异性的检测方法来满足转基因标识管理的要求。从长远角度看,建立转基因水稻PA110-15品系特异性检测方法可以有效防止该转基因事件流失到市场,并对我国水稻及其制品的安全管理,特别是对我国未通过安全评价转基因植物品系的筛查和监控方面具有重大意义。本研究根据转基因水稻PA110-15的5’端外源插入片段旁侧序列建立了普通PCR、实时荧光定量PCR和LAMP的检测方法。用这3种方法对转基因水稻PA110-15的品系特异性进行检测,并做比较。实验一是用定性PCR方法检测转基因水稻PA110-15品系特异性,实验二是用实时荧光定量PCR方法检测转基因水稻PA110-15品系特异性,实验三是用LAMP技术检测转基因水稻PA110-15的品系特异性。关于DNA提取方面,普通PCR和LAMP均使用SDS法,而实时荧光PCR是用的磁珠吸附法提取的DNA,因为该方法可以提取出高浓度模板,并且DNA质量良好。实验结果表明,这3种方法的特异性和稳定性都很高,LAMP的灵敏度最高,达到了 1拷贝/μL,普通PCR的灵敏度最低,为20拷贝/μL,定量PCR的灵敏度居中,为5拷贝/μL。但是,假阳性率与灵敏度成正比,LAMP最容易污染。这3种方法都满足对转基因水稻PA110-15的日常检测要求,可以根据具体情况选择具体方法。
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