CRISPR/Cas系统是存在于原核生物中的一种获得性免疫系统，其能帮助宿主抵御外源基因入侵。结核分枝杆菌中的CRISPR属于Ⅲ-A CRISPR系统。鉴于CRISPR位点的多样性，长期以来，该系统主要用于结核分枝杆菌分型，然而，其在结核分枝杆菌内的生物学功能至今未有报道。在本文中，我们证实结核分枝杆菌CRISPR/Cas系统含有唯一的crRNAs形成通路;CRISPR位点可以双向转录，并且含有独立的启动子及终止子。成熟的crRNAs(～65 nt)和CRISPR相关蛋白(Csm1-6和HtpG)可以形成复合物通过特异性切割外源基因以限制人工质粒转化。另外，值得关注的是，我们发现Cas蛋白能够帮助细菌抵抗巨噬细胞吞噬，从而提高细菌毒力。而且，分泌的Cas蛋白能够诱导巨噬细胞凋亡，也是重要的免疫蛋白能够引起T细胞反应。我们的发现说明细菌CRISPR/Cas系统可能和它的种类一样也具有多种功能。　　CRISPR/Cas系统帮助原核生物抵御外源基因入侵主要依靠于crRNA-Cas蛋白复合物，其中crRNA起引导作用，可以引导复合物特异性识别并切割外源基因。在TypeⅠ和TypeⅢ型CRISPR/Cas系统系统中，Cas6蛋白家族作为一类核糖核酸内切酶，能够在CRISPR区域前体转录物内的repeat序列处进行特异性切割，从而产生成熟的crRNA。然而，至今未有研究显示结核分枝杆菌的Cas6蛋白确实参与crRNA的生成。在本课题里，我们证明结核分枝杆菌的Cas6蛋白是一个依赖于二价金属离子的，具有序列和结构特异性的核糖核酸内切酶，其倾向于特异型切割repeat RNA。结核分枝杆菌的Cas6切割repeat RNA可产生多个产物，而且它还能非特异性地切割单链DNA。另外，体内试验证实结核分枝杆菌的Cas6确实参与crRNA生成，因此在抵御外源基因入侵方面发挥重要作用。