肾透明细胞癌KLF2表达水平与患者预后的相关性研究

来源 :安徽医科大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:hongshu16
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
背景:全球每年有超过14万人因肾细胞癌死亡,并且发病率逐年升高,严重威胁人类生命健康。肺Krüpple样转录因子(Lung Krüpple like factors,KLF2)是KLFs家族重要成员之一,作为核转录因子在肺、血管和肾等组织中表达,参与胚胎、肺部发育,血管形成和免疫调节等生命活动并且与肿瘤发生发展密切相关。我们前期的数据分析发现KLF2与肾透明细胞癌总体生存率显著相关。本文通过生物信息学分析和细胞与分子实验相结合的方法探索KLF2在肾透明细胞癌的表达以及与患者预后的相关性。方法:在癌症基因组图谱计划(The Cancer Genome Atlas,TCGA)、基因本体论(Gene Ontology,GO)和c Bio Portal等数据库中下载肾透明细胞癌基因表达、甲基化和信号通路等数据以及相应的临床病理资料和生存资料。首先,分析KLFs在泛癌中的表达水平,根据KLFs在肾透明细胞癌的表达差异做多因素Cox分析。其次,构建多因素Cox回归模型探讨KLF2表达差异对肾透明细胞癌患者预后的影响。然后,探讨KLF2基因启动子甲基化和突变。此外,通过慢病毒体系构建KLF2过表达细胞系,在细胞水平探讨KLF2的作用。最后,利用GO和基因变异集分析(Gene Set Variation Analysis,GSVA)信号通路探讨KLF2基因参与的信号通路。结果:(1)TCGA数据库分析显示,KLFs在肾透明细胞癌中多低表达。同时单因素和多因素Cox回归分析显示KLF2表达是肾透明细胞癌总体生存率的独立预后因素。(2)KLF2基因在肾透明细胞癌中存在高甲基化,甲基化水平与KLF2表达呈负相关。甲基化酶抑制剂处理癌细胞后,KLF2表达上调。(3)肾透明细胞癌组织芯片实验结果显示,KLF2表达水平与肿瘤病理分期呈负相关,与Ⅱ期相比,Ⅲ期KLF2表达显著降低。(4)GO和GSVA信号富集分析结果表明KLF2低表达可能参与上皮间质转化。慢病毒构建KLF2过表达细胞株,蛋白免疫印迹显示KLF2过表达后E-钙粘蛋白上调、N-钙粘蛋白和波形蛋白下调。结论:(1)KLF2表达水平与肾透明细胞癌低生存率相关,肿瘤分期越高,KLF2表达水平越低。(2)甲基化可能是KLF2表达降低的一个因素。(3)KLF2可能通过上皮间质转化通路参与肾透明细胞癌的进展。生物信息学结果分析与实验结果一致,过表达KLF2抑制细胞迁移和上皮间质转化相关指标蛋白。
其他文献
明清北京故宫是我国古代城市建筑遗产中的典型代表,故宫建筑组群在中国古代官式建筑中的地位首屈一指,蕴含着大量优秀的古代建筑艺术成就。其中故宫组群的建筑色彩处理手法就是极具价值的宝贵遗产之一。近年来,我国色彩学、美术史学、建筑史学等多领域专家学者对中国传统色彩进行深入的梳理与挖掘,形成了具有中国特色的色彩理论,但既往研究多立足于传统色彩的文化内涵、装饰艺术等定性理论研究,关于传统色彩的搭配规律多集中于
学位
修筑于世纪之交的中东铁路,沿线地形多变,地貌多样,因此俄方设计建造了大量的桥隧、涵洞和展线等交通工程设施用以克服地理障碍。日俄战争后,日方先后接管南支线长大段和南支线其余路段与干线,为增大运行效率、提高运输能力又增建了数量可观的桥梁等设施。及至日方归还中东铁路管理权,该线路已经拥有了数量庞大、类型众多、设计精良和技术先进的铁路交通工程设施群。本论文以中东铁路沿线的桥梁、隧道、涵洞和展线等铁路交通工
学位
随着现代城市生活日益高效快捷,办公空间声环境逐渐引起了人们的关注,房间内的噪声问题极易分散办公人员的注意力,甚至会导致工作绩效下降等问题。在目前办公空间声环境的设计与研究中,越来越多的学者从使用者工作绩效的角度出发,努力追求高工作效率的办公声环境,但是办公空间声环境对视觉认知工作绩效的影响研究尚未得到系统的研究和重视,确定什么类型的声源、什么范围的声压级以及什么范围的混响时间能有效提高从事视觉认知
学位
历史街区是见证城市历史、传承城市文化重要的空间载体。随着街区研究的关注点完成从遗产历史性向遗产可持续性的转变,处理商业化发展与文脉延续之间的矛盾变得愈发迫切。与此同时,对非物质文化要素的关注成为城市遗产保护的新趋势,这也要求管理部门在规划角度上应兼顾空间场所的物质环境与人文内涵。作为哈尔滨城市文化与记忆的象征,中央大街历史文化街区在百年间进行过多次改造更新工程,但长久以来,其更新工程的主要侧重点都
学位
格拉夫顿建筑事务所是世界上女性合作的少数国际公认的建筑事务所之一,也是首次获得普利兹克奖的女性建筑师组合。格拉夫顿是都柏林一条街道的名字,她们的事务所就坐落在这条街上,伊冯·法雷尔和谢莉·麦克纳马拉以街道的名字命名她们的事务所,而不是个人的名字,她们的建筑和经验,道德和文化深深扎根于这个位置,体现场所的重要性。作为传统上(并且至今仍是)以男性为主导的职业领域中的先驱,她们在开创出模范性的专业道路的
学位
地方认同是由人地互动的本质发展而来的人与地方的情感联结,对于地方发展和当地居民的主观幸福感具有重要影响。物质空间环境是人地情感最重要的影响因素之一。快速城镇化和现代化的背景下,我国乡村正在经历前所未有的空间形态演变,出现了人口流失和“空心化”的问题,面临着严重的地方认同危机,迫切需要地方视角下的研究和规划干预。本文以黑龙江省黑河市爱辉区的沿江村落为例进行了三个方面的研究。一是对沿江村落的空间形态进
学位
学位
新型冠状病毒肺炎疫情所带来严峻的挑战让我国乃至全球的目光都凝聚于突发公共卫生事件。本次疫情的潜伏周期长、传播面广泛等特点,使社区成为很长一段时期内防疫工作的重要战略基地。随着我国疫情防控工作重心的转变,社区日常的防控自治凸显出其重要性,除了从城市规划层面和社会层面进行探索、整理社区防疫空间治理的方法以及社区空间场所的建设,还应该探索社区、社会环境和居民的心理与行为之间的关系,整合分析影响要素以及评
学位
步行既是一种绿色低碳的交通方式,也是一种轻松健康的生活方式。作为城市中覆盖最广的公共空间,城市街道是步行行为的主要容器。优化城市街道的步行品质对提升城市包容、健康、宜居等多方面能力有重要的催化作用。现有的街道步行品质的评价指标存量巨大,因研究尺度、目的和对象不同形成各自为政的评价体系。大多数文献汇集于城市的宏观和中观尺度的建成环境探究,另一部分研究从行人的微观尺度细致分析,但在人本尺度结合客观环境
学位
改革开放以后,我国城镇化发展速度较快,七普显示我国城镇化率已经达到63.89%,同时我国城市建设也取得了巨大成就。然而在经济放缓,人口红利减弱和老龄化加剧等因素的交叠作用下,我国部分城市出现了人口流失、经济衰退等现象。东北地区部分城镇由于区域竞争力不足、经济欠发达等原因也出现了收缩现象。2017年10月,中共十九大报告指出生态保护红线、永久基本农田和城镇开发边界划定是处理好生活、生产和生态空间格局
学位