重组游仆虫核糖体蛋白L11与肽链释放因子体外相互作用的分析

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蛋白质合成是细胞内最重要的生命活动之一,这一过程包括核糖体上新生肽链合成的起始、延伸和终止。核糖体蛋白L11(ribosome protein L11)是一种高度保守的蛋白质,是蛋白质合成过程中的几个步骤所必需的。核糖体蛋白L11由N-末端和C-末端两个结构域组成。研究表明,L11的N-末端在蛋白质合成中作为分子开关,在多肽链的延伸阶段与EF-G相互作用对EF-G依赖的迁移过程是必需的。在肽链终止阶段与RF1(肽链释放因子)相互作用对RF1识别终止密码子UAG的功能是必需的。L11上包含有一个与具有噻唑抗性的抗生素结合的靶位点,这种结合会抑制依赖延伸因子的核糖体的活性,同时对转录因子的功能以及相关的反应也是相当重要的。  本研究从八肋游仆虫(Euplotes octocarinatus)大核基因组中克隆到核糖体蛋白L11基因,构建了重组表达质粒pGEX-6p-1-L11,通过谷胱甘肽-Sepharose4B亲和层析,纯化了重组融合蛋白GST-L11。利用获得的目的蛋白制备了多克隆抗体。并研究了游仆虫的核糖体蛋白L11与第一类肽链释放因子eRF1a的体外相互作用。本研究的主要进展如下:  本研究根据已知的核糖体蛋白L11保守氨基酸序列设计引物,扩增克隆了该游仆虫的核糖体蛋白基因片段,并对其核苷酸序列进行了分析。根据测得的序列设计特异性引物,并利用游仆虫的端粒序列(C4A4C4A4C4A4C4)为引物,扩增得到基因的全序列。序列分析表明,该基因全长为709bp,编码区由531bp组成,编码176个氨基酸,不含内含子。该基因在GenBank登陆号为EF061066。  将游仆虫的核糖体蛋白L11基因构建于原核表达载体pGEX-6p-1中,得到的重组表达质粒pGEX-6p-1-L11转化至E.coli BL21(DE3),IPTG诱导表达获得融合蛋白GST-L11。表达产物经谷胱甘肽-Sepharose4B亲和层析得到了纯化。Western blot分析表明该蛋白为融合有GST的L11蛋白。  通过酶切的方法将融合蛋白的GST标签切除,得到纯化的目的蛋白L11。采用切胶回收的方法回收目的蛋白,并将回收产物免疫大鼠,制备抗体,ELISA检测抗体效价达1∶8,000。Western blot检测证明抗体特异性良好。该多克隆抗体为进一步研究核糖体蛋白的功能奠定了基础。  分别将游仆虫核糖体蛋白的融合蛋白GST-L11与第一类肽链释放因子的融合蛋白His-eRF1a在体外进行表达,并利用其中一个蛋白与其相应的特异性亲和层析作用,进行Pull down实验,研究与另一个蛋白的相互作用。Western blot分析两个蛋白的体外相互作用的产物结果呈阳性,证明两个蛋白在体外是相互作用的。  这一结果提示,与原核生物一样,低等真核生物的核糖体蛋白L11在肽链终止过程中可能起一定的作用。
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