元代是版图空前广大、对外交流也十分活跃的一个朝代，其与东南亚许多国家的往来也是较为频繁。在双方各方面的相互交流中，药物交流是其中一个显著的方面。元朝与东南亚间的药物交流主要有两个途径，一是东南亚诸国向元朝的朝贡以及元朝给予的相应的回赐；一是元朝与东南亚的贸易往来，这其中，药物是主要的商品，尤其在东南亚输入元朝的物品中，而中国也有部分药物出口到东南亚。本文将首先对元朝与东南亚间药物交流的途径和方式、历史状况进行探讨总结，对药物交流过程中有关药物的管理、交流的药物种类及交流的特点等问题也做了分析和论述。再次，本文将进一步探讨元代中国与东南亚诸国药物交流和贸易发展的历史原因，主要包括元朝医药的发展及医人地位的提高、元政府对海外贸易的重视、元朝社会的需求三个方面。最后，本文将从政治经济、医药饮食两个方面总结元朝与东南亚药物交流给双方带来的影响。