【摘 要】
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肺癌是世界上发病率和死亡率最高的恶性肿瘤之一,我国是肺癌发病率和死亡率最高的地区之一,肺癌严重威胁着人们的健康和生命。云南宣威是我国肺癌的高发区,尤其是肺腺癌,且呈逐年上升的态势。虽已有很多研究,但大多集中在疾病环境成因分析,目前,关于宣威肺癌发生的分子机制仍然缺乏。揭示宣威肺癌发生的分子机制将有助于全面阐释宣威地区肺癌高发的特性,对于宣威肺癌的诊断、治疗和预防具有重要的理论意义和临床应用价值。基
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肺癌是世界上发病率和死亡率最高的恶性肿瘤之一,我国是肺癌发病率和死亡率最高的地区之一,肺癌严重威胁着人们的健康和生命。云南宣威是我国肺癌的高发区,尤其是肺腺癌,且呈逐年上升的态势。虽已有很多研究,但大多集中在疾病环境成因分析,目前,关于宣威肺癌发生的分子机制仍然缺乏。揭示宣威肺癌发生的分子机制将有助于全面阐释宣威地区肺癌高发的特性,对于宣威肺癌的诊断、治疗和预防具有重要的理论意义和临床应用价值。基于此,本研究拟通过二代测序技术对宣威10个肺腺癌患者的癌组织和癌旁肺组织进行转录组m RNA测序,9组肺腺癌患者的癌组织和癌旁肺组织进行micro RNA测序。通过差异基因分析、基因富集分析、基因共表达网络分析等方法系统比较分析两类组织中的基因表达差异,以期挖掘出宣威肺癌发生的关键因子。主要结果如下:(1)对云南肺腺癌进行转录组测序分析,共筛选得到306.64G的clean bases,以|log2Fold Change|>1&padj<0.05作为筛选条件,共筛选得到3591个符合筛选条件的差异表达基因,其中显著上调的基因有2008个,1583个基因为下调表达。、KEGG富集分析显示,这些基因主要富集在ECM-受体相互作用、神经活性配体-受体相互作用、细胞粘附分子、补体和凝血级联等通路上。加权基因共表达网络分析发现green,yellow以及turquoise三个基因共表达模块与肺癌的发生最显著关联,富集分析结果显示模块内基因主要与肺腺癌的发展、浸润和转移等密切相关。生存分析显示,CCL20、F2RL1和SPP1三个基因与肺腺癌的预后有显著关联,可作为云南肺腺癌肿瘤潜在的药物治疗靶点与临床生存预后指标。(2)通过小RNA测序对已知的miRNA进行分析,miRNA分析发现共有117573317个s RNA分别比对到已知的1796个miRNA成熟体和1467个miRNA前体上。预测成熟体119个以及前体122个。差异表达分析发现117个差异miRNA(padj<0.05),其中表达上调的差异miRNA有54个,表达下调的miRNA有63个。靶基因预测结果显示117个差异miRNA有8382个靶基因。靶基因GO和KEGG分析发现,这些靶基因主要与蛋白质的结合以及肌动蛋白细胞骨架组织途径等有关。筛选到三个重要的miRNA hsa-miR-126-3p、hsa-miR-516b-5p和hsa-miR-182-3p,其中生存分析显示,hsa-miR-126-3p与肺腺癌病人生存有关,可作为肺腺癌病人临床预后的潜在标记。综上所述,本研究通过比较宣威肺腺癌患者的两种组织中的m RNA和miRNA的表达差异,识别了与肺腺癌发生有关的关键因子,本研究为全面揭示宣威肺腺癌发生的分子机理提供了新的科学数据和依据。
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