目的:自身免疫性甲状腺炎（Autoimmune Thyroiditis,AIT）是常见的内分泌系统疾病,由易感基因与环境因素相互作用而致病,表观遗传学是研究两者相互作用机制的重要手段。AIT主要特征为自身免疫耐受破坏而产生针对甲状腺的自身抗体、甲状腺淋巴细胞浸润,导致甲状腺细胞破坏。浸润的淋巴细胞中,CD4+T细胞具有介导自身免疫的功能。近年来,CD4+T细胞的DNA甲基化异常在自身免疫性疾病的作用机制成为研究热点。本课题拟在AIT患者与正常对照人群的CD4+T细胞中筛选与AIT相关的异常DNA甲基化修饰位点。研究成果将有助于阐明AIT的发病机制,为疾病的诊治提供新的线索。方法:本研究中所有研究对象均来自于中国医科大学附属第一医院就诊的女性患者,其中共有37名桥本甲状腺炎患者和50例健康志愿者。每名研究对象均签署知情同意书。采集外周抗凝血30毫升进行CD4+T细胞分析和DNA提取。我们将提取的CD4+T细胞DNA样本送到华大基因有限公司进行Illumina Infinium Human Methylation850K Bead Chip检测,对得到的芯片结果进行分析,得到DNA甲基化差异位点和差异基因,之后进一步进行GO分析和KEGG通路分析。结果:与正常对照对组比较,AIT组共有12215个差异甲基化位点,其中有2056个高甲基化位点,对应于1278个基因;10591个低甲基化位点,对应于4484个基因。DNA甲基化改变主要发生在Gene body和TSS1500。功能富集分析显示:发生高甲基化改变的基因涉及的主要细胞成分为细胞突起、细胞核和细胞膜等,涉及的分子功能包括序列特异性DNA结合、β-内啡肽受体活性、3’,5’环状GMP磷酸二酯酶活性等,涉及的生物学过程主要包括神经系统发育、神经元产生等;发生低甲基化改变的基因涉及的主要细胞成分为细胞周边、质膜、细胞连接等,涉及的分子功能包括离子跨膜转运蛋白活性、细胞骨架蛋白结合和肌动蛋白结合等,涉及的生物学过程主要包括多细胞生物过程、神经发生和细胞分化等。信号通路分析显示:高甲基化基因与吗啡成瘾、Rap1信号通路、黏合连接、雌激素信号通路等信号通路有关,低甲基化基因与蛋白质消化吸收、神经活性配体-受体相互作用、醛固酮合成和分泌、cAMP信号通路、肌动蛋白细胞骨架调控和昼夜节律等信号通路有关。进行相关分析后发现,与FT3、FT4、TSH、TgAb和TPOAb相关的差异DNA甲基化位点分别有9、3、10、58和54个。进行基因注释后发现,差异DNA甲基化基因中,HYDIN和KCTD1与TPOAb、TgAb和TSH均呈负相关;CCDC3与TPOAb和TgAb均呈负相关,与FT4呈正相关。结论:AIT患者外周血CD4+T细胞中发生DNA高甲基化改变的基因涉及的生物学过程主要包括神经系统发育、神经元产生等,涉及的信号通路主要有吗啡成瘾、Rap1信号通路、黏合连接、雌激素信号通路等;发生低甲基化改变的基因涉及的生物学过程主要包括多细胞生物过程、神经发生和细胞分化等,涉及的信号通路主要有蛋白质消化吸收、神经活性配体-受体相互作用、醛固酮合成和分泌、cAMP信号通路、肌动蛋白细胞骨架调控和昼夜节律等。差异DNA甲基化基因中,HYDIN和KCTD1与TPOAb、TgAb和TSH均呈负相关;CCDC3与TPOAb和TgAb均呈负相关,与FT4均呈正相关。