噬冷菌硼和抗生素协同选择的初步探究及三株新菌的多相分类

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抗生素的长期滥用,使细菌的耐药性不断增强,加剧了抗生素抗性基因的传播和扩散。研究表明,重金属和抗生素存在协同选择作用。在重金属污染严重的区域,即使没有抗生素的存在,也发现了抗生素抗性基因。硼作为一种在环境中广泛分布的半金属元素,其与抗生素是否存在协同选择作用还未有相关报道。本实验测定了 8株噬冷菌(Algoriphagus)的生长曲线,选取其中7株菌进行了抗生素和硼的最小抑菌浓度测定。并对耐药噬冷菌(Algoriphagus resistens NH1T),海洋噬冷菌(Algoriphagus marinus am2T),耐硼噬冷菌(Alboriphagus boritolerans JCM 118970T)是否存在硼和抗生素协同选择进行了研究,结果表明:硼为10mmol/L时,经过30代的代际培养,海洋噬冷菌、耐硼噬冷菌没有硼与抗生素的抗性协同选择,但耐药噬冷菌对氧氟沙星的抗性与硼有明显的协同选择,硼胁迫后耐药噬冷菌对氧氟沙星的最小抑菌浓度提高了4倍。耐药噬冷菌代际培养后的转录组测序,筛选出351个差异基因(上调基因351个,下调基因237个),可能为耐药噬冷菌对氧氟沙星胁迫的应答基因;筛选出135个差异基因(其中上调基因48个,下调基因87个),可能为耐药噬冷菌硼胁迫代际培养中的差异基因;筛选出115个差异基因(上调基因98个,下调基因1 7个),可能为耐药噬冷菌对硼胁迫的应答基因;筛选出10个可能与硼和抗生素协同选择的基因,基因编号分别为AS141 RS04315、AS141 RS04360、AS141_RS04375、、AS141_RS04380、、AS141_RS11640、、AS141_RS11660、AS141 RS12925、、AS141 RS15695、、AS141 RS21740、、AS141 RS22360。本论文完成了三株新菌的多相分类。菌株N3T,分离自中国云南省的抚仙湖,革兰氏阴性,无运动性,杆状,红色。异养,兼性厌氧,氧化酶阳性,过氧化氢酶阴性。最适生长温度30℃(生长范围4-45℃),最适pH 7.0-8.0(生长范围6.5-9.5)。基于16S rRNA基因序列的系统发育分析表明,菌株N3T与Algoriphagus aquaeductus的相似性为97.4%,Algoriphagus shivajiensis为 97.3%,Algoriphagus alkaliphilus为 97.2%。DNA G +C 含量为 43.9mol%,醌为 MK-7,主要脂肪酸是 iso-C15:o,summed feature 9(10-methyl C16:o and/or iso-C17:1ω9c),summed feature 3(C16:1ω6c)6c/C16:1ω7c)和iso-C16:0。主要极性脂为磷脂酰胆碱(PC),磷脂酰乙醇胺(PE),未鉴定的糖脂(GL),两种未鉴定的磷脂(PL1,PL2),两种未鉴定的氨基脂(AL1,AL2)和四种未鉴定的脂质(L1,L2,L3,L4)。根据形态学,生理学和分子学特性以及系统发育的特性,确认菌株N3T为Algoriphag为 属的新种,其名称为Algoriphagus lacus sp.nov.。模式菌株是N3T(= KCTC 62622T= MCCC 1H00308T)。菌株F3105LT和B3213T分离自荣成海参池,均为革兰氏阴性,杆状,兼性厌氧菌。16S rRNA基因和系统发育分析表明,属于Aliidiomarina属。分别命名为快生别样海源菌(Aliidiomarina celeris),模式菌株为F3105T(=MCCC 1H00223T=KCTC 52891T);海沉积物别样海源菌(Aliidiomarina marininisedimenarium),模式菌株为B3213T(=MCCC 1H00321T= KCTC 62446T)。
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