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本文对采自黑眶蟾蜍分布区内的黑眶蟾蜍样品，进行了线粒体DNA控制区(D—loop)和细胞色素b(Cytb)部分序列的测定分析，并结合形态测量学统计分析对黑眶蟾蜍的种群变异与亲缘生物地理进行研究。通过研究，我们得出了以下结论：
1.获得来自19个地理种群111只黑眶蟾蜍的D—loop部分序列，全长956bp，分为52个单倍型，单倍型多样性H为0.974，核苷酸多样性π为0.1603；11个地理种群共58只黑眶蟾蜍的Cytb部分序列长度为596bp，分为20个单倍型，单倍型多样性为0.906，核苷酸多样性π为0.00433。共享单倍型分析显示：华南西部地区并不存在阻碍黑眶蟾蜍迁移的地理障蔽。
2.基于D—loop部分序列的系统进化树分析，不同黑眶蟾蜍地理种群聚合为4支(A、B、C和D)：分支A由香港、南澳、广州、韶关、玉林、花莲、赣州、琼中、玉林、白沙、五指山、温州和防城的单倍型构成；分支B由香港、琼中、五指山、赣州和梅州的单倍型构成；分支C由花莲、台东、香港、莆田、东山、南澳、汕头和梅州的单倍型构成；分支D由云南玉溪的3个单倍型构成。华南东部大陆地区的种群地理距离较近却分在了2个不同分支(A和C)，推测莲花山对此区域内的黑眶蟾蜍起到了地理障蔽作用，同时韩江成为莲花山两侧部分黑眶蟾蜍进行相互交流的通道。
3.基于D—loop部分序列的遗传多样性分析显示：云南玉溪种群不论内部还是与其他地理种群间均显示了较大的遗传分化。推测此现象出现的原因是受到青藏高原抬升的影响。
4.基于D—loop部分序列的单倍型进化枝分析显示，黑眶蟾蜍作为华南区的广布种，其扩散中心可能是纬度较低的广西南部、广东中部、海南和东南沿海地区；南岭山脉可能是黑眶蟾蜍在冰期的避难所。
5.基于D—loop与Cytb部分序列的研究结果来看，针对黑眶蟾蜍物种，D—loop的变异速率大于Cytb。在进行种群遗传与亲缘地理研究时，宜采用D—loop序列，而Cytb区段的变异相对较小，因此在更高阶元的系统发育研究中，应该会有更好的应用效果。
6.测量9个地理种群196只黑眶蟾蜍的17个形态性状，并进行主成分分析。结果显示，黑眶蟾蜍在形态度量特征上并未出现明显的分化。分布在不同纬度上的群体，在形态度量特征上是有一定的差异的，但纬度相近的群体之间的差异不明显。说明影响黑眶蟾蜍形态差异的主要原因是环境因素。