我国资本市场历经三十多年的发展,目前已经进入了建设中国特色现代资本市场的新阶段,党的十九大强调要深化监管体制改革,优化资本市场资源配置效率。在此背景下,证券交易所通过实施问询监管政策,将监管重心从事前审核转向事后监督,逐渐成为资本市场提高信息披露质量的一线监管机构,成为维护资本市场秩序的新晋督导。交易所问询监管对提高公司信息披露透明度、会计政策选择的合规性、企业投资决策的合理性,以及防范重大金融风险等方面都发挥着至关重要的作用。作为资本市场监管理念转变的重大举措,学术界和实务界都广泛关注问询函的监管效用,探究“刨根问底”式问询是否能够真正找出并解决上市公司意图隐藏的全部问题。在这种外部强关注下,不仅会对上市公司产生监管压力,也会影响投资者对公司的预期和判断,进而影响公司管理者的决策。创新作为公司发展的核心源动力,是公司提高竞争力和市场地位的关键。企业创新投资会受到内外部环境的双重影响,交易所问询作为一种强有力的外部监管方式,可能会通过影响公司外部环境和内部经营状况,进一步影响企业创新投资决策。已有学者发现,财务报告问询函会向市场传递不利信号,导致公司股价下跌、管理层频繁更换以及融资约束加剧等问题。在这种情况下,管理者既要承受财务报告问询的压力,又要承受公司股东和外部投资者的问责压力,很有可能无法理性的做出判断与决策,管理者为了降低企业以及自身的风险承担,会选择将资金投入到短期可获利项目中,管理者短视加剧,创新意愿降低。此外,外部投资者为了保障自身利益,会对上市公司收取更高的融资溢价,导致公司融资约束提升,可动用资金减少,使得企业创新投入降低。基于上述分析,本文探讨财务报告问询函是否会对企业创新投入产生不利影响,并进一步分析具体的影响路径,以及如何能够提高企业创新投入。本文从信号传递理论、信息不对称理论出发,以我国2016-2021年A股上市公司数据为研究样本,探究财务报告问询函与企业创新投入之间的关系,验证财务报告问询函特征是否会产生进一步监管效应;检验融资约束、管理层短视的中介效应;进行分板块、分行业检验;进行产权性质、管理层持股、分析师关注的调节效应检验。实证检验结果发现:（1）财务报告问询函与企业创新投入之间存在着负相关关系;（2）上市公司多次收函和延期回函会导致企业创新投入进一步降低,而与“研发”相关的财务报告问询函会促进企业创新投入;（3）融资约束和管理层短视都发挥着部分中介效应;（4）在中小板、创业板以及高新技术企业中,财务报告问询函与企业创新投入呈负相关;（5）管理层持股能够有效缓解问询与创新投入之间的负相关关系;（6）在非国有企业中,财务报告问询函与企业创新投入呈负相关;（7）分析师关注会加剧财务报告问询对企业创新投入的不利影响。基于上述结论,本文提出如下建议:企业要强化会计信息披露质量,重视交易所问询函;加强财务报告研发信息披露监管,缓解信息不对称问题;重视企业创新,拓宽融资渠道,保障研发资金投入;构建完善的高管激励机制,培育管理者重视创新的理念,实现公司长期可持续发展。分析师要提高职业素养,客观分析问询函内容,注重企业长期业绩,保障分析的客观性和独立性,促进企业创新。上述研究丰富了财务报告问询函经济后果的研究文献,完善了问询监管的研究体系框架,为证券交易所未来加强重点监管提供方向,对进一步提高资本市场活力、提高公司创新水平具有重大意义。