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显斑拱背果蝇种复合指显斑拱背果蝇及与其形态上非常相似的几个物种。本文首先通过形态学和DNA序列数据(包括基于线粒体细胞色素C氧化酶亚基I基因和核内内转录间隔区1片段序列)分析探讨了该种复合的物种组成,证明其由4个物种组成：广布于亚洲大陆东部的显斑拱背果蝇L. clarofinis、分布于日本的L.sp.1aff.clarofinis(简称sp.1)、分布于我国四川盆地的L. sp.2aff. clarofinis(简称sp.2)以及分布于云南的L. sp.3aff. clarofinis(简称sp.3)。我们通过系统发育分析证明,sp.1代表显斑拱背果蝇种复合中首先分化的一个分枝,其次是clarofinis,而sp.2和sp.3之间最后分化。形态和系统发育分析结果显示,sp.2、sp.3两个物种内存在雄性阳基侧突形态的非遗传多型,意味着阳基侧突非遗传多型可能起源于二者最近共同祖先。我们还分析了种复合内物种间(及clarofinis种内)性梳形态的变化,推测了性梳在不同物种中的发育模式,即：显斑拱背果蝇种复合中,性梳可能由短的横向刚毛列通过旋转和融合而发育形成；在sp.2中,参与性梳形成的短刚毛列的列数较clarofinis f口sp.1中的少,是sp.2第1性梳短于后两个种的原因；在sp.3中,雄性前足的刚毛发育模式可能完全雌性化,导致性梳在该种雄性中二次丢失。基于物种分歧时间估计、亲缘地理学分析、群体遗传多样性及遗传结构分析的结果,我们推测复合内物种分化均发生在上新世及其后；第三纪末(3-2Mya)全球气候变冷的趋势以及第四纪冰期—间冰期的交替可能是推动显斑拱背果蝇种复合物种分化的主要环境因素：冰川通过将物种隔离为异域的种群,促进了物种分化及种内多样化；四川盆地可能是显斑拱背果蝇种复合内的冰期避难所,并成为sp.2隔离分化成新物种的主要原因；对不同海拔环境的适应可能促进了sp.2和sp.3间的分化。种复合中,clarofinis的遗传多样性远高于其它3个种；推测该种在冰期幸存于多个避难所,隔离在冰期避难所的群体在间冰期和冰后期扩散和杂交,使该种维持了较高的遗传多样性；物种水平上(而不是针对特定种群)的某种纯化选择(purifying selection)可能是导致sp.3低遗传多样性以及种群间遗传同质性的主要原因。