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本研究采用线粒体DNA多态性分析和核基因微卫星分子标记技术揭示可可西里保护区藏羚羊遗传多样性状况,并且采用线粒体DNA多态性分析研究了青海、西藏、新疆三个地理单元的藏羚羊群体遗传分化情况。 本文选择扩增青海、西藏、新疆三个地理单元41个藏羚羊个体线粒体D—loop区近5’端486～488bp序列,共检出79个突变位点;所检测的41个个体存在40种单倍型,仅青海与新疆地理单元有一个共享单倍型;三个地理单元间单倍型多态性(h)为0.999,核苷酸差异均数(k)为16.511,核苷酸多样性(Pi)为0.034;新疆地理单元的核苷酸多态性明显低于西藏、青海群体;群体内平均遗传距离青海最高(0.038),新疆最低(0.028)。这些结果均说明这三个地理单元内藏羚羊群体异质性高,其中青海地理单元异质性最高,新疆最低。 青海与新疆群体间的分化水平最低,这两个群体间的基因流最大;而新疆与西藏群体间遗传分化水平最高,群体间基因流最低。UPGMA、N-J法构建的系统发育树显示三个地理单元间没有出现显著的遗传分化。 利用牛、羊的25对微卫星引物在青海地理单元内的75个干皮张中扩增,筛选出9对具有高度多态性的微卫星引物对藏羚羊遗传多样性进行研究。9对微卫星引物在75只藏羚羊基因组DNA中共检测到85个等位基因,平均每对引物检测到9.4个等位基因,每个位点平均有效等位基因数为6.519。说明微卫星两侧序列具有高度保守性,而核心序列具有高度多态性,是适合于在物种间相互扩增的。筛选到的9个微卫星位点在藏羚羊DNA基因组中的多态信息含量值介于0.753～0.881之间,说明检测的位点均为高度多态性。9个微卫星位点的平均基因杂合度为0.838,说明这9个微卫星位点在可可西里野生藏羚羊种群中具有较高的杂合度,从核基因角度揭示该研究种群具有丰富的遗传多样性。 本研究中,利用微卫星标记技术与线粒体D-loop区DNA多态性分析相结合的方法对藏羚羊遗传多样性进行分析,结果发现这两种标记均检测出藏羚羊野生种群具有丰富的遗传多样性,证明这两种标记是对藏羚羊的遗传结构分析有效的分子标记。同时说明核基因变异与核外基因均能很好地用于检测藏羚羊群体遗传结构。从线粒体DNA多态性和微卫星标记两方面研究结果证实我国藏羚羊遗传资源相当丰富,从保护遗传学角度揭示了科学保护藏羚羊这一物种具有很好的前景。最后就藏羚羊遗传保护研究中存在的问题和解决途径进行了探讨。