【摘 要】
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目的:通过生物信息分析FCGR3A与结直肠癌的临床相关性;寻找直接调节FCGR3A表达的miRNA,并验证其相关性。方法:从TCGA-COAD下载CRC患者转录谱信息与临床信息,整理后用R语言分析临床相关性,主要包括FCGR3A表达量与CRC患者临床分期、生存曲线的关系,以及FCGR3A不同表达量时,免疫浸润分析、基因集富集分析的差异。并通过Target Scan与miRanda数据库筛选直接调控
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目的:通过生物信息分析FCGR3A与结直肠癌的临床相关性;寻找直接调节FCGR3A表达的miRNA,并验证其相关性。方法:从TCGA-COAD下载CRC患者转录谱信息与临床信息,整理后用R语言分析临床相关性,主要包括FCGR3A表达量与CRC患者临床分期、生存曲线的关系,以及FCGR3A不同表达量时,免疫浸润分析、基因集富集分析的差异。并通过Target Scan与miRanda数据库筛选直接调控FCGR3A的miRNA,选取相关性最强的miRNA作验证实验。通过实时荧光定量PCR检测相关miRNA及FCGR3A基因的表达,Western blot检测miRNA过表达后FCGR3A蛋白的表达水平。结果:1.FCGR3A mRNA在分期T3/4的表达量显著高于T1/2（p＜0.001）。FCGR3A mRNA在CRC肿瘤组织的表达量明显高于癌旁正常组织（p＜0.001）。CRC患者总生存期、疾病特异性生存期与无进展生存期与FCGR3A mRNA表达量在全时间段无显著意义（p＞0.05）。2.免疫浸润分析中,血浆B细胞、CD8+T细胞、未活化CD4+T细胞、M0/M2巨噬细胞及未活化肥大细胞在CRC组织中均高表达,但血浆B细胞、未活化CD4+T细胞的表达水平在FCGR3A mRNA低表达组远高于FCGR3A mRNA高表达组（p＜0.001）,而MO巨噬细胞则在FCGR3A mRNA高表达组有更高的表达水平（p＜0.001）。同时,在FCGR3A mRNA高表达后,下游更多的同种异体移植排斥通路、上皮细胞间质转型通路、炎症反应通路、干扰素-伽马反应通路、KRAS信号上升通路及IL-6/JAK/STAT3信号通路被活化。而未折叠蛋白反应通路、胆固醇稳态通路等被下调。3.基于Target Scan与miRanda数据库预测出对FCGR3A具有直接调控作用的39个相关miRNA,选取负相关性最强的hsa-miR-92a-1-5p作验证实验。荧光定量PCR结果显示:在hsa-miR-92a-1-5p过表达后的HCT8、SW480细胞中,FCGR3A mRNA水平显著下降。Western blot检测结果与mRNA检测一致,在hsa-miR-92a-1-5p过表达后,HCT8、SW480细胞中FCGR3A的蛋白水平显著下降。结论:1.CRC组织中血浆B细胞、CD8+T细胞、未活化CD4+T细胞、M0/M2巨噬细胞等免疫细胞浸润明显。2.FCGR3A高表达的CRC组织中,上皮细胞间质转型通路、KRAS信号上升通路、IL-6/JAK/STAT3信号通路等被明显富集。3.hsa-miR-92a-1-5p是直接负性调控FCGR3A的miRNA。
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