行政追偿制度的本质在于对行政侵权有故意或重大过失的公务人员进行经济惩戒。该制度的有效实施,不仅能够增强公务人员责任感,同时还可以减轻国家的财政负担。我国的国家赔偿法对行政追偿作出了原则规定,地方立法对此进行了细化。但是,从该制度的实施情况看,不尽如人意,主要存在四个方面的问题:第一,我国的行政追偿没有独立的程序,致使行政追偿长期处于闲置状态。第二,追偿途径不明晰,实务中,即便行政赔偿机关通过诉讼行使追偿权,法院对此的认识也不一致。第三,举证责任不明确,若由行政赔偿义务机关单方认定相关公务人员故意或重大过失,有失公平;第四,追偿的执行和救济程序不完善,致使追偿权的行使与被追偿权人的合法权益均未得到保障。行政追偿程序是行政追偿制度的核心,也是该制度有效运行的保障。在借鉴域外相关制度经验的基础上,我国的行政追偿程序应从以下四个方面进行完善:第一,完善立法,保证追偿程序有效开启,通过规范启动期限与确定赔偿义务机关定位来促进追偿的启动。第二,借鉴域外的可诉模式,尝试在现行的体制下,将行政赔偿程序和追偿程序合二为一,减少赔偿义务机关的主观影响,让法院参与进来。第三,在举证责任上明确证明责任应当由赔偿义务机关承担本证,而被追偿的公务员提供反证。第四,完善执行和救济程序,再通过监察机关对执行和救济进行监督,确保能够在保障被追偿人的救济权的前提下有效的行使追偿权。