LTA4H rs17525495基因型对炎症性肠病发病的影响

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研究背景炎症性肠病(inflammatory bowel disease,IBD)主要包括克罗恩病(Crohn′s disease,CD)和溃疡性结肠炎(ulcerative colitis,UC),其病因和发病机制尚未完全阐明,目前主要认为与环境、遗传、肠道微生态等多因素相互作用有关。在5-LO途径中,白三烯A4水解酶(LTA4H)催化LTA4向LTB4转化。James Jupp等人在一项关于IBD的研究中发现,活动性炎症性肠病患者结肠活检组织中LTA4H染色细胞数量是健康对照组的4倍,并且伴随LTB4及中性粒细胞的显著增加。通过千人基因组项目,研究人员证实rs17525495位于LTA4H转录启动子区,是一种功能性单核苷酸多态性(SNP)位点,其基因型影响LTA4H转录。因此,在本研究中,我们尝试对UC、CD患者和健康人群rs17525495基因位点进行基因分型,研究该基因位点与IBD患者之间的关联。研究目的1、研究IBD与LTA4H SNP rs17525495是否有关联,进一步从基因水平筛查IBD易感人群;2、从基因水平探索IBD治疗方案;研究方法1、纳入2008年1月至2019年12月在南昌大学附属人民医院确诊的377例IBD患者(227例UC,150例CD),700例健康对照者(HC);2、将UC和CD患者的石蜡活检标本取出,然后切下3段20um厚样本,立即转移到EP管中并-20℃保存。从健康对照组采集2毫升肝素抗凝血全血,立即放置4°C冰箱储存;3、使用FFPE DNA试剂盒(OMERA,美国)从上文所述的UC和CD患者的石蜡活检标本中提取基因DNA。还使用DNeasy Blood&Tissue(QIAGEN,美国)从健康对照组(HC)全血中提取基因DNA。4、采用ABI 7500real-time PCR系统(ABI,美国),在20ul反应体积中用TaqMan探针法对SNP rs17525495进行基因分型。5、统计学分析。研究结果1、比较HC与CD组时,在TT基因型上出现了显著性差异,T等位基因的存在可能是克罗恩病的遗传危险因素之一;2、在CD患者中,T等位基因的存在显著增加了克罗恩病患者需要糖皮质激素的比例。结论总之,我们发现LTA4H rs17525495位点T等位基因是CD的一个危险因素。更重要的是,基因型与药物疗效之间存在明显的相关性,rs17525495 T等位基因的存在使CD患者对激素治疗更敏感。
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