证券市场在国民经济中正在发挥着日益重要的作用，证券公司作为证券市场的重要组成部分，在十几年的发展中取得了长足的进步，但同时也暴露出了一些问题。而这些问题的产生又主要是由于证券公司内部控制系统不健全或者无效所引起的。因此，对证券公司内部控制系统的研究便成为目前理论上和实践上都迫切需要研究和解决的重要课题。 本文通过对证券公司面临的主要问题以及新《证券法》和中国证监会“分类监管、扶优限劣”的监管思路给证券业发展带来的影响的研究，指出证券公司完善内部控制机制的紧迫性。在证券公司内部控制理论研究的现有基础COS0模型、舞弊理论、以及《证券公司内部控制指引》等的基础上，通过大量案例的分析，对证券公司的主要经营业务的内部控制及监控系统建设提出了具有较强操作性的指导意见。最后通过对中信证券有限公司的财务数据进行分析，对证券公司风险控制指标尤其是净资本的计算进行了演示，并指出以净资本为核心的风险控制指标对证券公司进行风险监管的重要性。