后肢去负荷引起的骨骼肌萎缩转录组学研究

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目的:长期的石膏固定,卧床以及太空飞行等会引起废用性骨骼肌萎缩。这种去负荷所导致的肌萎缩,伴随着复杂的生化和生理变化,具有潜在的破坏性后果,长期影响患者的生活质量。因此本课题研究后肢去负荷骨骼肌萎缩的分子调控机制,为有效治疗和预防去负荷所导致的肌萎缩提供理论依据。方法:制备大鼠尾部悬挂的后肢去负荷肌萎缩模型。采用RNA-Seq技术检测大鼠后肢去负荷后12 h、24 h、36 h、3 d、7d比目鱼肌中差异表达基因。运用皮尔森相关性热图和主成分分析(PCA)分析差异基因表达谱,在此基础上采用GO和基因表达富集分析(KEGG)对差异基因进行聚类分析,最后运用IPA进一步分析特定的生物学过程。结果:大鼠比目鱼肌在后肢去负荷不同时间点(12 h,24 h,36 h,3 d,7 d)分别有712、1109、1433、1162、1182个基因表达上调,1186、1324、1632、1446、1596个基因表达下调。主成分分析提示大鼠比目鱼肌在后肢去负荷后7d内存在三个不同的转录阶段,后肢去负荷后12-24h为转录阶段Ⅰ,后肢去负荷后36h为转录阶段Ⅱ,后肢去负荷后3-7d为转录阶段Ⅲ。KEGG分析和GO注释表明,第一个转录阶段主要是氧化应激等应激反应被激活,细胞增殖和血管生成受到抑制;第二个转录阶段主要是蛋白水解系统被激活并伴随一定程度的炎症反应;第三个转录阶段主要是蛋白水解系统被广泛激活,能量代谢被显著抑制,衰老、快慢肌转换等过程被激活。结论:大鼠骨骼肌在去负荷后不同的生物学过程被依次激活,根据这些被激活的生物学过程可以将骨骼肌去负荷后三个转录阶段依次定为“应激期”、“萎缩启动期”缩和“萎缩期”。我们的研究不仅有助于了解去负荷肌萎缩的分子机制,还可能为去负荷肌萎缩防治提供重要的时间窗。
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