TRPM8通道双配体耦合协同作用机制的研究

来源 :河北工业大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:kuwa_li
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
瞬态受体电位M型离子通道8(TRPM8)是一种多模态的非选择性阳离子通道。WS-12为TRPM8最有效激活剂,需内源性小分子PIP2存在才能充分发挥激活效果。然而,TRPM8通道门控特性不明晰,WS-12和PIP2双配体耦合协同作用的分子机制尚不清楚。理解TRPM8通道分子机制对靶向药物的筛选和设计具有重要意义。本文主要采用同源模建和分子动力学模拟的方法,围绕配体激活TRPM8通道分子机制进行研究,在分析TRPM8通道的门控特性基础上,重点分析了WS-12激活TRPM8通道分子机制;PIP2引发TRPM8通道的变构效应;WS-12和PIP2双配体耦合协同激活TRPM8通道分子机制。主要结论如下:1、TRPM8通道门控结构域存在回环和螺旋两种不同构象,并且能够相互转换。处于螺旋态的门控结构域阻碍离子通透氨基酸的数量仅有一个,且构象稳定,与周围结构域的相互作用强,结构域间的运动协同,有利于门控开启。2、分子动力学模拟结果表明配体WS-12与TRPM8通道结合过程中存在一种低能态。配体WS-12的结合增加了电压敏感域(VSLD)柔性,促使腔体扩大;同时增强了TRP螺旋和跨膜结构域的相互作用,进而有抬升和拉拽TRP螺旋的趋势,门控结构域向外扩张运动,门有开启的运动趋势。但S5螺旋空间位阻存在,较难将配体的作用能高效传递到门控结构域,因此配体WS-12单独激活TRPM8通道的作用弱,与实验结果相一致。3、配体PIP2通过静电相互作用引发胞内结构域抬升;引发S5螺旋运动,可使TRP螺旋抬升,增强各结构域间的运动协同性,有利于门控结构域形成螺旋态;然而,门控结构域向外扩张的运动趋势不明显。4、结合WS-12和PIP2的双配体体系中,WS-12引发VSLD构象变化克服了S5螺旋阻碍TRP螺旋抬升引发的能量信息传输受阻;PIP2引发的TRP抬升作用进一步加强,并通过VSLD构象变化获得门控结构域外扩的运动;WS-12和PIP2协同导致门控结构域柔性降低,回环向螺旋构象转变,有利于维持门控开启。综上所述,TRP螺旋作为TRPM8通道的门控调控的“中心枢纽”,这是因为TRP螺旋直接与门控结构域相连接。WS-12引发的TRP螺旋外扩运动和PIP2导致的TRP螺旋抬升运动,在门控开启和维持上具有耦合协同性。
其他文献
近年来,由于人们对消费需求的转型升级,国内互联网服务业飞速发展,积累了海量的用户评论信息。对这些评论进行情感分析,有助于机器充分理解评论中蕴含的态度观点和情感倾向,帮助网络平台了解用户需求、社会热点、舆情走势等,具有巨大的研究意义。然而,传统方法仅能推断出一个文档或句子整体的情绪极性,无法针对句子的具体方面进行分析。方面级情感分类解决了这个问题,它可以推断出文本序列中更全面、更深入的情感极性,更能
学位
目的:胃癌(Gastric cancer,GC)是高复发转移的恶性肿瘤,转移机制复杂。细胞间粘附分子-1(Intercellular adhesion molecule-1,ICAM-1;CD54)是近年来备受关注的免疫炎症因子。ICAM-1通过与淋巴细胞功能相关抗原(Lymphocyte function-associated antigen-1,LFA-1)结合,在白细胞粘附中发挥重要作用。此
学位
[目的]:基于生物信息学检测Pannexin1(Panx1)在人非小细胞肺癌组织中的表达水平,探讨人非小细胞肺癌A549细胞中micro RNA-122(miR-122)对靶基因Panx1的表达及细胞增殖、迁移侵袭能力的影响。[方法]:通过生物信息数据库搜集和验证Panx1在肺癌组织中的表达及其与miR-122之间的关系。选用人肺癌A549细胞系,用miR-122模拟物(mimics)对细胞进行转
学位
图数据是一类由结点和边构成的高维且抽象的数据,它能够对很多不同领域中包含复杂结构的数据进行建模,例如,医药领域中药物靶点相互作用关系数据、社交推荐领域中错综复杂的人物关系数据等。传统的机器学习和深度学习方法无法直接应用在高维、抽象的图数据上,通过图表示学习方法将高维、抽象的图数据映射成低维特征向量表示成为了研究热点。经图表示学习得到的低维特征向量不仅保留了图的拓扑信息,还能被广泛地应用于诸多图数据
学位
目的:本课题组前期实验证明,在裸鼠移植瘤模型内HMGA2可促进肾癌细胞EMT的发生,有促瘤作用。目前HMGA2在肾癌中的具体作用机制尚不明确。因此,本实验通过研究HMGA2对EMT、TGF-β/Smads信号通路和细胞凋亡相关分子的影响,来探讨HMGA2在人肾癌ACHN细胞中的作用机制。方法:1、通过RNA干扰技术(si RNA)转染人肾癌ACHN细胞,构建HMGA2低表达的细胞株。实验分为三组:
学位
近年来,恶性肿瘤的发病率呈现出年轻化、发病率和死亡率“三线”走高的趋势,它是威胁人民生命健康的头等杀手,已经成为制约国家发展和社会进步的巨大障碍。虽然在肿瘤的治疗方面生物学和医学都取得了进步,但是由于肿瘤微环境的复杂性和患者的个体差异性,单一治疗方式很难取得理想的治疗效果,恶性肿瘤的治疗仍面临着巨大的挑战。因此采取多机制、多靶点的协同抗肿瘤新策略,对于改善癌症临床治疗效果、提高患者治疗指数具有重要
学位
针对煤矿井下电气设备产生的时变谐波问题,设计了分段快速傅里叶变换(FFT)方法对时变谐波进行分析检测,利用检测的谐波数据进行电气设备故障诊断。通过硬件和软件设计研发了电能质量分析装置。利用电气设备产生的谐波进行故障诊断,实现了电气设备故障在线检测,避免了停机造成的经济损失,节省了大量劳动力投入,具有十分重要的应用和研究价值。
期刊
报纸
随着人类对物质需求的日益增长,环保和能源危机已成为全球发展急需解决的问题。太阳能因其环境友好、大量、价廉易得等优点被认可,利用太阳能电池将太阳能转变为电能是解决能源问题的途径之一,因此提高太阳能电池能量转换效率成为了研究热点。二氧化钛(TiO2)是一种常见的宽带隙半导体光阳极材料,但是其载流子迁移率较低同时电子-空穴复合速率较高,导致TiO2的光电转换效率变低。多金属氧酸盐(简称多酸,POM),是
学位
肿瘤微环境因具有缺氧、低p H值及过量的H2O2等特点,严重降低了放疗、化疗等常规肿瘤治疗的效果。相比之下,肿瘤催化治疗作为一种利用酶催化反应调节肿瘤微环境以产生抗肿瘤作用的新策略,可实现有效的肿瘤治疗并避免毒副反应。纳米酶作为一种新兴的具有过氧化物酶(Peroxidase,POD)及过氧化氢酶(Catalase,CAT)等酶样催化活性的纳米材料,结合光热性能不仅能够调控肿瘤内部的生物活性,同时也
学位