白鹇种群的微卫星及线粒体控制区遗传结构

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通过采集了来自福建、指名、峨眉3个亚种,20个采样地点的82个白鹇个体,将其分成闽北、赣中、湘南等11个地理种群后,利用5对微卫星引物以及线粒体控制区部分序列的研究,初步探讨白鹇亚种以及种群间的遗传结构。白鹇种群中微卫星杂合度最高的是赣南种群(HE=0.4500,Ho=0.6000),最低的是川南种群(HE=0.2000,Ho=0.2000);基于微卫星数据的Bottleneck分析结果表明,白鹇各亚种及各地种群都未经历遗传瓶颈(P>0.05)。总共1100bp线粒体控制区序列中共发现32个变异位点,所有样品属于20个单倍型,包括7个为种群间共享单倍型,而13个为种群特有单倍型;其中2号单倍型的分布最广,在7个不同的地理种群中都有分布;而赣中、赣南、川南、皖北和鄂北这5个地理种群没有发现特有的单倍型。白鹇线粒体控制区数据分析体现出高单倍型多样性和低核苷酸多样性的特征。基于中介网络图、贝叶斯树、最大似然树和最大简约树的分析显示,20个单倍型可划分为三个支系,闽北和井冈山种群较明显地分布在两个不同分支中。白鹇的各个亚种、各个地理种群以及各个单倍型间都已经产生了一定的遗传分化,但这种分化并没有表现出明显的地理隔离特点。地理距离最大的川南和闽北种群,两个种群相距1777公里,其微卫星遗传距离为Fst=0.09704 (P=0.99099);线粒体遗传距离φst=0.52703(P=0.99099),差异不显著,可能与川南种群样本数量过少有关。赣中和井冈山的种群地理距离最小,相距170公里。其微卫星遗传距离为Fst=0.12509 (P=0.00000);线粒体控制区遗传距离Φst=0.41326 (P=0.00901),差异性反而显著,这应当与井冈山种群地理位置特殊,处于罗霄山脉之中,与其它种群的基因交流受限有关。AMOVA分析显示白鹇种群微卫星差异和D-loop差异主要体现在各地理种群内(微卫星:Rst= 0.12319, P= 0.00020+-0.00014,占总变异的87.68%;线粒体控制区:Fst= 0.22502, P= 0.00000+-0.00000,占总变异的77.50%),亚种间的遗传差异很小(微卫星:Rct= 0.04014, P= 0.20554+-0.00412,占总变异的4.01%;线粒体控制区:Fct=-0.00772, P= 0.50653+-0.00506,占总变异的-0.77%)。各种群间的遗传距离和地理距离的相关性不显著(微卫星r=0.126,P>0.05;线粒体控制区r=-0.045,P>0.05),白鹇种群的形成过程中,地理距离并不是影响种群遗传结构的决定性因素。
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