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目的：观察HBeAg阳性慢性乙型肝炎（Chronic Hepatitis B）患者核苷（酸）类似物抗病毒治疗后不同时期外周血HBsAg、HBeAg定量，并探讨其与HBeAg血清转换之间的关系。方法：对22例核苷（酸）类似物抗病毒治疗的HBeAg阳性CHB患者随访2年，分别于抗病毒治疗的基线、12周、24周、48周和96周收集患者的血清，化学发光微粒子免疫检测法检测HBsAg、HBeAg定量；实时荧光定量聚合酶链反应（real-time FQ-PCR）检测血清HBV DNA载量；同时全自动生化分析仪检测血清谷丙转氨酶（alanineaminotransferase, ALT）水平。结果：抗病毒治疗2年后，7例患者发生HBeAg血清转换，15例患者HBeAg仍为阳性。两组在基线状态下HBV DNA、HBsAg和HBeAg定量及ALT水平无统计学差异（P>0.05）。在治疗过程中，发生HBeAg血清转换的患者12周HBV DNA和12周、24周、48周HBeAg定量的下降率均高于未转换的患者（P<0.05）。12周达到HBV DNA阴转的患者在后期仍有36.4%的几率不发生HBeAg的血清学转换。12周、24周和48周HBeAg定量小于0.976、1.059和0.369（log10S/CO）以及12周HBeAg较基线下降大于45.3%、48周较基线下降大于82.1%，均可预测2年后e抗原的血清转换，ROC曲线下面积分别是0.833，0.859，0.962，0.872和0.910（P<0.05），敏感性均为83.3%，特异性分别为92.3%，92.3%，100%，92.3%和100%。以12周血清HBsAg定量预测2年HBeAg血清转换的ROC曲线下面积为0.795，12周HBsAg小于3.49（log10IU/ml）预测的敏感性和特异性分别是83.3%和76.9%。结论：HBeAg阳性CHB患者核苷（酸）类似物抗病毒治疗后，血清HBeAg定量的持续下降，可作为预测后期HBeAg血清转换的良好指标。