【摘 要】
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岩羊（Pseudois nayaur）是中国国家二级保护野生动物,生活在青藏高原以及附近区域。现有对岩羊遗传多样性的研究主要集中在四川、宁夏种群,缺乏西藏、新疆等地区的数据,局限于Cyt b、D-loop区等短片段序列,缺乏mt DNA序列数据分析结果。采集补充岩羊各分布地代表样品及数据,研究岩羊各地理种群系统发育关系并评估遗传多样性对了解岩羊现状、科学保护具有实际意义。本研究通过收集了61个岩羊
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岩羊（Pseudois nayaur）是中国国家二级保护野生动物,生活在青藏高原以及附近区域。现有对岩羊遗传多样性的研究主要集中在四川、宁夏种群,缺乏西藏、新疆等地区的数据,局限于Cyt b、D-loop区等短片段序列,缺乏mt DNA序列数据分析结果。采集补充岩羊各分布地代表样品及数据,研究岩羊各地理种群系统发育关系并评估遗传多样性对了解岩羊现状、科学保护具有实际意义。本研究通过收集了61个岩羊样品,利用三代混合测序获得24条mt DNA序列,整合Genbank已公布的岩羊完整mt DNA及片段序列,共获得29条mt DNA序列、113条Cyt b序列以及122条D-loop区序列,数据包括了四川、青海、云南、新疆、甘肃、宁夏和西藏7个地理种群。基于mt DNA数据集、Cyt b数据集和D-loop数据集得到以下的研究结果:1.mt DNA数据集构建的系统发育树被分为三大支,第一个大支包括西藏和新疆种群,第二大支是宁夏种群,第三大支主要包括四川、青海、甘肃种群。Cyt b数据集和D-loop数据集构建的系统发育树被分为四大支,第一个大支为新疆种群,第二大支为西藏种群,第三大支是宁夏种群,第四大支主要包括四川、青海、甘肃和云南种群。2.不同地理种群之间的遗传分化系数分别在0.0647至0.5694、-0.1208至0.7455、-0.400至0.8734区间,宁夏、西藏和新疆种群都与其他地理种群的遗传分化差异大。云南种群与四川种群Cyt b和D-loop区数据集计算得到的Fst的值为负值,两个种群之间的基因交流非常普遍。3.各个地理种群之间的平均遗传距离值分别在0.0271至0.0375、0.0297至0.0385、0.1543至0.2513区间,西藏、新疆和宁夏种群与其他的各地理种群之间的平均遗传距离值为最大,遗传距离为最远。4.所有个体全部种群的单倍型多样性（Hd）分别为0.980、0.986和0.960,核苷酸多样性（Pi）分别为0.0197、0.0284和0.1538,岩羊整体显示比较高的遗传多样性水平,整体具有丰富的遗传变异,宁夏种群的核苷酸多样性值为最低。5.分别定义到23种、83种和49种单倍型。mt DNA数据集得到1种共享单倍型,Cyt b数据集得到2种共享单倍型以及D-loop数据集得到4种共享单倍型,除共享单倍型外,其余单倍型都为各地理种群独有的。本研究从线粒体DNA序列水平入手分析和厘清岩羊不同地理种群间的系统发育关系和遗传多样性,为开展岩羊遗传资源的保护和利用提供科学依据和理论指导。
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