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中国高等教育的主体是地方大学,但是伴随高校扩招和各省域经济发展水平的差异,省属大学的财政状况一直处于劣势地位,高等教育内部各级各类高校协调发展,以及高校与社会经济的协调发展问题依旧严重。省级教育统筹作为“十二五”重要教育政策,在增加高等教育投入、协调高校发展等方面被赋予重要使命,对作为试点省份的上海统筹高等教育投入的状况进行监测,具有政策咨询意义,本研究以上海为例对其省级教育统筹下的高等教育投入做了实证研究得出：1.上海市高等教育财政投入努力程度较高,2011年高等教育财政投入占GDP的比重为1.52%,高于全国平均水平0.87%,但与OECD平均水平1.6%有些许差距；除2011年外地方高等学校预算内教育经费占财政性教育经费的比重一直保持在99%左右；上海地方高校生均预算内教育经费占生均经费的比重在67.6%-80%；高等学校预算内教育经费占各级各类学校总预算内教育经费的25%左右,比例较高。2.上海地方普通高等教育生均预算内教育经费稳步增长,远远高于全国平均水平,但地方普通高职高专经费增长水平远远低于普通本科；地方成人高校预算内教育经费高于普通高职高专院校,教育事业经费拨款一直占据高等教育经费的主导地位,科研拨款呈下降趋势,尤其是普通高职高专院校和成人高校的科研拨款微乎其微。3.上海在统筹各级各类高校发展的过程中探索出有益道途,但尚未形成省级政府统筹下的各级各类高校协调发展的局面；上海市政府在高等教育财政投入中利用各类专项经费引导高校发展,统筹协调高校发展与区域社会经济发展之间的联接互动。笔者建议加大高等教育经费投入,落实生均经费基本要求；重视普通本科高校与高职高专、成人高校的协调发展；探索高校竞争性经费的项目治理机制。本研究的意义在于,理论层面,拓展高等教育投入研究的新视角,高等教育投入研究不再仅仅是量上的关注,统筹协调的质的发展也应该是高等教育投入研究的重要领域；应用层面,上海市统筹高等教育财政投入,协调各层次高等学校发展的经验或教训,值得上海和其他各省份反思与借鉴。