要有效解决“三农”问题，必须大力发展农产品加工业，提高农业整体效益。大力发展农产品加工业的有效途径之一就是实施农产品供应链管理，然而农产品供应链是由不同的经济实体组成，各自都有不同的优化目标和私有信息，这些优化目标往往与系统整体优化目标相冲突。为了优化农产品供应链决策，每一个农产品供应链成员不仅要对自身的目标进行局部优化，并且还要考虑对其他成员和农产品供应链整体的影响，与其他成员一起协调运作，达到供应链整体优化目标。因此，农产品供应链协调问题成为农产品供应链管理研究的重要内容。本文首先简要介绍了供应链的概念及结构模型，引出了农产品供应链的定义以及将供应链管理思想导入农产品加工业的重要意义；然后，从系统科学的角度提出了农产品供应链协调的定义及类型，并深入剖析了影响农产品供应链协调性的主要障碍，指出农产品供应链的协调运作主要会受到契约与激励机制、利益分配机制这两个基础性协调机制的制约；最后，本文综合运用系统科学理论、博弈论、委托代理理论和组织行为学等理论，对农产品供应链的两大协调机制进行了深入的研究，从而最终构建了农产品供应链协调机制的系统框架。