随着国家财政体制的改革和公共财政体系的建立和完善，政府投资逐渐从竞争性、盈利性投资领域转向为公众服务的公益性项目，这种投资方向的转变更适用于我国的经济发展，但是政府公共工程投资建设过程中发现了一些问题。为了建立完善的政府公共投资机制，解决政府公共投资中存在的问题，国家审计机关提出对公共投资资金使用情况进行全面审计，即将合规性审计和绩效审计并重进行。然而为了有效地展开公共工程绩效审计，需要建立一套完善的政府公共工程绩效审计指标体系，以便对公共投资进行监督和测评。本文深入分析了政府公共工程绩效审计指标体系，目的在于完善现有的政府公共工程绩效审计指标体系，为其他项目或部门绩效审计提供指导和借鉴。本文在大量文献研究的基础上，以公共工程理论和绩效审计理论为指导，结合公共工程自身的特点，从绩效审计的内涵和本质出发，构建了政府公共工程绩效审计指标体系。指标体系的内容涉及经济性审计、效率性审计和效果性审计三个方面的14个指标。采用层次分析法确定政府公共工程绩效审计指标体系的权重，通过大量的计算和调整，所构建的判断矩阵都通过了一致性检验，验证了指标体系的科学性和合理性。此外，本文通过对具体案例的分析，得出该公共工程的绩效审计综合得分，检验了政府公共工程绩效审计指标的可行性和可操作性。本文主要研究政府公共工程绩效审计指标，科学合理的确定指标体系的权重，并结合具体案例对指标体系的可操作性进行检验，以确定政府公共工程绩效审计指标体系构建的科学性、合理性和可行性。