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油菜是植物油的第三大来源，也是我国主要的油料作物，提高油菜籽含油量以增加单位面积产油量是当前油菜研究的首要目标，也是提高油菜生产效益的重要途径。油菜籽中油份的形成和积累是一个复杂的生理生化过程，因此油菜籽含油量性状是一个受多基因控制的典型数量性状；基因与环境的互作效应又导致含油量的遗传易受环境影响。这些都给常规育种选育高含油量品种带来了困难。有必要利用现代分子生物学技术手段，将与油脂代谢相关的功能标记整合到图谱中，并对含油量性状进行QTL定位，从而确定功能基因与QTL之间的关系。这将在一定程度上促进甘蓝型油菜含油量 QTL的克隆和利用。模式植物拟南芥的研究已有很多成果可以共享，基于甘蓝型油菜与拟南芥较近的亲缘关系和基因组较高的同源性，两者的比较基因组研究将有助于加快油菜油脂研究的进程。 本研究以欧洲高含油量油菜品种Sollux和中国高油分自交系Gaoyou为遗传背景，由282个株系构成的DH群体为材料。利用拟南芥基因与甘蓝型油菜 EST序列比对后发展的功能标记构建的图谱为依托，用9个环境的含油量田间数据对甘蓝型油菜含油量性状进行 QTL定位分析，探讨功能相关标记与 QTL之间的关系，并利用本研究在油菜成功定位的功能相关标记与拟南芥进行了比较基因组研究。主要结果如下： 1.根据拟南芥中相关基因序列信息与油菜EST序列比对后，共设计了452对能扩增不同基因的引物对，其中121对能在双亲Sollux和Gaoyou DNA中扩增出清晰的多态性条带。经DH群体检测后，118对引物的扩增产物在双亲及群体DNA中能检测到清晰的多态性，共得到143个功能相关分子标记位点。 2.以124个SSR标记和110个EST标记构建了全长为1925.7cM的遗传连锁图谱，标记间距离为8.23cM。对整合进连锁群的EST标记涉及的基因进行分类，其中39个基因与油脂合成各代谢途径有关，47个基因与非油脂代谢的其他功能有关。 3.用9个环境含油量的数据，应用复合区间作图法对DH群体进行QTL定位，共检测到12个QTL影响含油量性状。其中有2个能稳定遗传的QTL，分别能在9个与7个环境中检测到，单个QTL可解释的变异平均值分别为12.00％与4.92%。涉及22个不同基因的功能相关分子标记与含油量性状有关，其中10个与油脂合成代谢途径有关。 4.利用TAIR网站的seqview软件，对整合到甘蓝型油菜遗传图谱的86个功能相关基因在拟南芥中的同源基因进行了电子定位。这些基因在拟南芥5条染色体上均有分布，共覆盖拟南芥基因组的109.40Mb。通过甘蓝型油菜和拟南芥之间的比较作图，共得到了26个共线性区域，涉及了油菜标记位点76个和拟南芥基因67个。