基于深度学习的磁共振波谱重建算法研究

来源 :厦门大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:prodigyvip
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
核磁共振(Nuclear Magnetic Resonance,NMR)作为一种有效的分析技术被广泛地应用于化学物质的结构鉴定中。通常情况下,多维磁共振波谱的采样时间主要取决于其间接维数据的点数,并且当NMR谱的维度增加时,所需的实验时间关于维度呈指数式增加。非均匀采样(Non-uniform Sampling,NUS)技术可以通过在实验时减少谱图间接维的采样点数来缩短实验时间。如果直接采用零填充的方式对非均匀采样(也称为欠采样)后的NMR数据进行处理,就会在谱图中形成大量重叠伪峰。因此,我们需要使用数据处理算法对欠采样的NMR谱图进行重建。传统NMR谱重建方法主要是利用NMR谱图的先验知识(如稀疏性、低秩性等)对建立的优化方程进行正则化约束,再结合最优化算法求出近似解。虽然这些方法能提供良好的重建结果,但是具有计算复杂度大,重建时间长的缺点。深度学习具有强大的非线性拟合能力,并且因为有硬件的加持而拥有很快的计算速度。鉴于此,本文提出了两种基于深度学习的NMR谱重建方法,包括利用虚拟回波减少模型训练时间的编解码高分辨率神经网络重建方法和基于模型驱动的迭代自适应阈值网络重建方法。本文提出了一种编解码高分辨率神经网络。该网络在高分辨率神经网络的基础上引入了编解码模块,该模块已被证明在去除伪峰方面具有良好的效果。接着本文创新地将虚拟回波算法引入到数据的预处理中,该算法可以将NMR谱数据的虚部变为0,因此网络输出层的通道个数只需要设置为1来表征数据的实部即可。实验证明,该方法不仅可以比传统的NMR谱重建算法hmsIST和SMILE具有更快的重建速度,还比经典的卷积神经网络DenseNet和U-Net具有更高的重建质量。同时,相比较于现有的基于深度学习的NMR谱重建方法,我们的方法所需要的模型训练时间也更短。目前大多数深度神经网络的结构都缺乏理论支撑和可解释性,但是传统NMR谱重建算法具有坚实的理论基础。因此,本文借鉴了传统NMR谱重建算法中的迭代收缩阈值算法(Iterative Shrinkage Thresholding Algorithm,ISTA)的理论,设计了一种新颖的基于数学模型驱动的迭代自适应阈值网络。这种方法通过将数学运算层和卷积层作为一个模块,来表征ISTA迭代过程中的一步计算,并使用多个相同的模块组成神经网络的整体结构。实验表明,该方法可以以更少的模型参数量和更短的重建时间来获取高质量的NMR重建谱。
其他文献
2020年是小康社会全面建成的一年,这也标志着我国现有贫困人口已全部脱贫,脱贫攻坚任务如期完成,进入到后脱贫时代。但随着社会风险的变化与生活标准的提高,未来仍会有人口重新返回贫困。这就要求后脱贫时代的扶贫工作重心应放在风险评估以及风险监测上。残疾人作为弱势群体,在可行性能力受损的情况下,相较于常人更容易返贫,应当成为监测体系关注重点。但学界现有研究对返贫这一主题关注度不够,针对残疾人家庭返贫评估的
学位
不确定决策是在备择选项发生结果已知但发生概率未知的情况下进行的决策。在不确定决策中,模糊耐受性用来衡量人们选择不确定选项的意愿,线索搜寻表现则用来评估人们在不确定情境下的决策行为。关于青少年与成年人不确定决策的对比研究发现,青少年相比成年人表现出更高的模糊耐受性和更少的线索搜寻努力;青少年的高模糊耐受性被视为引发青少年药物滥用、反叛等不良行为的重要原因(Tymula,et al.,2012;van
学位
精准扶贫取得巨大成就,“第一书记”政策发挥了重要作用。第一书记作为扶贫政策执行者,为了实现扶贫目标,有效动员多元扶贫力量,在驻村过程中必然会与多元主体发生互动关系。在当前研究中,对第一书记互动主体的研究更多局限于“二元主体”,即第一书记与村干部之间的互动。“第一书记”政策执行中,除了以村支书为主的村干部,还有多个行动主体,包括村民、驻村工作队员、驻地的县乡政府以及第一书记原来的派出单位。本研究克服
学位
社会信用体系是社会主义市场经济体制和社会治理体制的重要组成部分,对于整顿和规范市场经济秩序、改善市场信用环境、降低交易成本、防范经济风险具有重要意义。当前,社会信用体系建设规划纲要已然收官,我国正在加快构建以国内大循环为主体、国内国际双循环相互促进的新发展格局,这对社会信用提出了更高的要求。作为一项复杂的系统工程,社会信用体系的完善只有依靠政府、市场、社会等多方主体共同参与,才能让良好的信用为下一
学位
城管对于城市长久发展起着重要作用,其目的是形成政府系统内各部门之间、政府与社会、政府与公众之间的良性互动,维持城市系统有序运转。随着大数据时代的到来,一系列新技术逐渐与人们的生活产生紧密联系,传统以政府为导向的城管模式已不能满足社会多样化需求,在实践中产生了各种不适应问题。伴随信息通信技术的演进、知识社会的发展以及创新的民主化进程,国家对于推进治理体系与治理能力现代化的要求不断提高,加强信息化建设
学位
蓝宝石(A12O3)具有良好的光学、物理、化学等特性,是现代化工业重要的基础材料,广泛应用于仪器仪表、军工、消费电子、LED衬底等领域。目前蓝宝石衬底的主要生产加工流程有多线切割、边缘倒边、双面研磨、退火、抛光、最终清洗等。蓝宝石晶锭切割是蓝宝石衬底加工的前段加工工序,是采用将电镀金刚石线布在渐进式槽轮上,然后将晶锭切割成一定厚度的蓝宝石切割片。本文主要采用电镀金刚石线配合多线切割机进行蓝宝石晶锭
学位
自我国台湾地区“十二年国教”课程纲要实施以来,其中小学教育便跨入了新的发展阶段。“十二年国教”课程纲要不仅延续了“九年一贯课程”时期的“一边一国”表述方式,也给予“大陆形象”一个全新的定位。本研究以文化认同与文化动态理论为理论关照,在收集、整理和分析相关文献基础上,通过文本分析方法,剖析台湾初中和高中一年级上、下册及二年级上册的社会学习领域教科书中有关“大陆形象”的描述,具体从政治、经济、社会三个
学位
检测线圈是核磁共振系统最前端单元,其性能对NMR信号质量起着决定性的作用。核磁共振波谱仪通常有多通道,分别进行1H/19F 核和杂核(31P、13C、15N)等液体样品检测,相应的探头射频线圈也有1H核线圈和杂核线圈两个。为了获得高灵敏度,核磁共振线圈通常需要贴近样品。高场液体核磁共振探头线圈通常为横向线圈,射频场方向与线圈轴向垂直,线圈越靠近样品时,填充因子越高,所需的激发功率越小,接收到的NM
学位
随着无线通信技术的快速发展,集成化、高性能的射频收发系统逐渐得到了人们的关注。滤波器作为该系统的基本组成元件,其性能的优劣将在很大程度上影响整个系统的工作质量,小型化、高性能的滤波器一直是广大科研工作者研究的重点。近些年来,伴随着新概念的提出以及实际工程的需要,一系列特殊性能的滤波器(宽阻带滤波器,可吸收滤波器,人工表面等离激元滤波器)应运而生,引发了新一轮的热点。基于上述情况,我们做了一系列的工
学位
台湾制造业对于其经济发展的作用十分关键,一直是经济增长的核心支柱。作为一个小型外向经济体,贸易是台湾制造业技术进步的主要途径。近年来,世界制造业转型升级,高新技术与先进制造业的发展逐渐成为核心竞争力。因此,研究近年来外贸对台湾制造业技术进步的影响,具有一定现实意义。本文以国际贸易理论及内生增长理论为基础,结合台湾制造业技术进步的特点,归纳总结出对外贸易对台湾制造业技术进步的影响机制,突出表现为学习
学位