E2F1及EIF4A3介导的环状RNA circSEPT9在三阴乳腺癌发生发展中的功能及分子机制研究

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目的越来越多的研究提示,环状RNA跟许多癌症的发生和发展密切相关。本研究旨在探讨环状RNA circSEPT9在人三阴乳腺癌(triple-negative breast cancer,TNBC)中的表达、生物学功能以及分子机制,并分析其表达调控机制,为其作为TNBC临床诊断和治疗新的分子靶点提供科学依据。方法对4对TNBC组织和癌旁正常组织开展转录组测序(RNA sequencing,RNA-seq)分析,获得差异表达的circRNA表达谱。采用Sanger测序、PCR扩增、RNA酶R消化及放线菌素D处理等方法进行circSEPT9的鉴定。应用原位杂交技术(in situ hybridization,ISH)和实时荧光定量PCR(quantitative real-time PCR,qRT-PCR)检测TNBC患者中circSEPT9的表达,并分析其表达与临床病理特征的关系,进一步评价其预后。通过一系列体内外功能实验,探讨circSEPT9在TNBC发生发展中的作用。机制上,采用染色质免疫共沉淀(chromatin immunoprecipitation,ChIP)、荧光素酶报告基因和RNA免疫共沉淀(RNA immunoprecipitation,RIP)分析探讨E2F1和EIF4A3对circSEPT9生物发生的潜在调控作用。此外,应用生物信息学分析、荧光素酶报告基因、荧光原位杂交(fluorescence in situ hybridization,FISH)、RNA pull-down、western blot和免疫组织化学(immunohistochemistry,IHC)等实验研究circSEPT9能否通过与miR-637结合进而调控肿瘤相关的信号通路。结果CircSEPT9在TNBC组织和细胞中的表达明显高于癌旁组织及正常乳腺上皮细胞,并且其表达水平与临床晚期及预后不良呈正相关。功能实验表明干扰circSEPT9可抑制体内外TNBC细胞的生长与转移,亦可诱导TNBC细胞凋亡及自噬。而上调circSEPT9则起到相反的作用。进一步的实验研究表明,circSEPT9可通过靶向miR-637调控白血病抑制因子(Leukemia inhibitory Factor,LIF)的表达,进而激活LIF/Stat3信号通路。此外,我们发现E2F1和EIF4A3可能促进circSEPT9的生物发生。结论E2F1和EIF4A3介导的circSEPT9可与miR-637结合促进LIF的表达及激活LIF/Stat3信号通路,从而促进三阴乳腺癌的发生与发展。因此,circSEPT9可作为潜在的TNBC生物标志物和治疗靶点。
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