一种九香虫防卫素的基因克隆与表达分析

来源 :贵州大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:cyx810625
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
抗生素的广泛使用对细菌遗传物质的突变诱发作用和对耐药型菌株的选择作用,导致了多重耐药细菌的广泛传播,对公共健康卫生埋下了巨大的隐患,因此现在急需开发新型的抗菌药物。抗菌肽作为一种具有免疫功能的内源性多肽,在生物发育和免疫过程中发挥着重要作用,同时抗菌肽不易产生耐药性、分子量小、广谱抗菌等优点让其成为了最具开发潜力的抗生素替代药物之一。昆虫生活在各种被病原微生物包围的环境中,具有非常强大的先天免疫系统,昆虫抗菌肽是先天免疫的重要成员,在昆虫抵御病原微生物的过程中发挥了重要作用。九香虫Coridius chinensis是半翅目(Hemiptera)中的一种药食两用昆虫。此前的研究表明该目昆虫体内具有丰富的抗菌肽,从九香虫体内分离的多肽及血淋巴具有较好的抗菌抗癌细胞活性。本研究选取九香虫为材料,基于九香虫转录组数据库克隆获得九香虫防卫素Cc Def2基因,对Cc Def2基因在九香虫体内的表达模式、Cc Def2成熟肽的结构特征及抗菌活性进行研究,为九香虫防卫素的生理功能研究和开发利用奠定基础。获得了以下结果:1.九香虫防卫素基因Cc Def2的克隆及生物信息学分析本研究基于九香虫转录组数据,运用相关生物信息学手段和防卫素结构特征筛选到九香虫防卫素基因Cc Def2,运用RT-PCR技术克隆验证获得其c DNA序列,其ORF为351 bp,编码116个氨基酸(aa),成熟肽段具43 aa,具有昆虫防卫素家族的分子结构特征,其分子量为4.70 k Da,理论等电点为9.10,为带有5个净正电荷的亲水性阳离子多肽;含有6个保守的半胱氨酸残基,形成3对二硫键,与1个α-螺旋,2个β-折叠片形成CSαβ-motif的高级结构。聚类分析研究表明,Cc Def2与红尾碧蝽防卫素的亲缘关系最近,两者的氨基酸序列相似性高达74.42%。2.九香虫防卫素基因Cc Def2的表达模式解析通过实时荧光定量PCR(Quantitative Real-time PCR,RT-q PCR)检测了九香虫防卫素Cc Def2基因的表达模式,结果显示:Cc Def2基因在九香虫的各个发育时期均有表达,且在5龄若虫的表达量显著高于卵、1-4龄若虫和成虫的表达量;对不同组织部位表达模式分析表明:Cc Def2基因表达量最高的组织为脂肪体,血淋巴次之,其它组织内的表达水平都相对较低。用细菌注射诱导九香虫成虫,Cc Def2基因的表达水平上调至12 h时达到最高水平,而后缓慢下调趋向于诱导前的水平。3.九香虫防卫素Cc Def2合成肽的抗菌活性抗菌活性检测结果表明,九香虫防卫素Cc Def2合成肽对金黄色葡萄球菌具有较佳的抗菌活性,对其余所检测的革兰氏菌均无抗菌活性,在浓度为40μg/m L时便能显著抑制金黄色葡萄球菌的生长,在浓度为80μg/m L时能杀灭金黄色葡萄球菌。九香虫防卫素Cc Def2合成肽对温度和p H都具有良好的耐受性,温度处理区间为-20-40℃及p H处理区间为3-10时仍能保持原有的抗菌活性。对离子强度比较敏感,当Na Cl浓度为10%时,细菌存活率为90.20%,Cc Def2多肽丧失了对金黄色葡萄球菌绝大部分抗菌活性。4.重组表达载体的构建及鉴定对设计的防卫素Cc Def2核苷酸序列进行优化,根据毕赤酵母密码子偏好性,用同义密码子代替稀有密码子,将GC含量由51.38%减少至46.25%,优化后基因的密码子适应指数(Codon adaptation index,CAI)由0.71增加到0.90,基于宿主有机体的低频率密码子的百分比(<30%)由2%降低至0%。将优化后用Xho I和Xba I分别对p MD18-T-Cc Def2和p PICZαA进行双酶切后,通过T4 DNA连接酶将具有互补粘性末端的目的片段和载体骨架连接,挑取阳性克隆经菌落PCR,双酶切及测序三步验证,成功构建了重组表达载体p PICZαA-Cc Def2。5.重组质粒在毕赤酵母中的分泌表达及抗菌活性测定为了实现Cc Def2的外源表达,用限制性内切酶Sac I将重组质粒线性化和磷酸化后,将线性化的重组质粒电转化到毕赤酵母感受态细胞GS115中,使重组质粒整合至毕赤酵母基因组中,通过抗生素筛选、Mut~+表型筛选、菌液PCR验证及基因组PCR产物测序验证筛选到阳性重组菌株GS115/p PICZαA-Cc Def2。将阳性重组菌株进行0.5%甲醇诱导,表达产物浓缩后经Tricine-SDS-PAGE检测,在发酵72 h和96 h的发酵上清中发现了约5.5 k Da左右的特异条带。浓缩的表达产物对所检测的5种革兰氏阳性菌都具有不同程度的抑菌活性,其中对金黄色葡萄球菌的抗菌活性最佳,但对3种革兰氏阴性菌都无抗菌活性。
其他文献
目的:本实验目的在于研究中药逍遥散+复方三子汤周期法给药对多囊卵巢(PCO)模型大鼠卵巢颗粒细胞中抗苗勒试管激素(AMH)及其II型受体(AMHR2)表达的影响,探讨补肾调泡周期法治疗多囊卵巢综合征(PCOS)的相关作用机制。方法:110只SPF级雌性SD大鼠,随机数字表法选取10只作为空白对照组,剩余100只来曲唑灌胃法造模,成功后,设立模型对照组、阳性对照组、A药(逍遥散)低剂量组、A药高剂量
伴随国家经济、文化、科学等方面的飞速发展,公民生活质量不断提高。近年来,人民的消费方向呈全球化、多元化发展态势,紧跟欧美发达国家,对于日护用品的消费和依赖程度愈演愈
本文以胡庚申教授的生态翻译学为理论指导,对The Origins of Himalayan Studies一书中的第七章Brian Hodgson and the Mammals and Other Animals of Nepal与第八章A Pioneer of Himalayan Ornithology进行翻译研究。所选章节主要描述了动物学家与鸟类学家霍奇森对喜马拉雅区域的哺乳动物与鸟类进行研
数字插画作为插画设计的一个重要组成部分,越来越得到人们的青睐。数字插画不但在书籍插图,海报宣传等传统插画应用领域被广泛应用,同时也在游戏设计,动漫制作,影视概念设计等新兴领域得到了更大的发展。当然,在数字插画不断发展的同时,带有中国元素或绘画风格的成熟的数字插画作品却不多见。为了解决这一问题,本文将研究如何将中国传统绘画中的工笔人物画造型语言与数字插画进行融合,让这种带有中国绘画风格的数字插画作品
图像分割是计算机视觉和人工智能研究的基本问题,其目的是提取出图像中待处理的对象。数字图像经常出现在诸如航空航天、遥感测绘、医学影像和通讯交通领域的实际问题中,受成像设备的差异性以及人为因素等的影响,很多图像都不可避免地呈现出灰度分布不均匀的特点。到目前为止,就如何准确分割出灰度不均图像中的目标,许多学者进行了大量的研究。多年以来,基于偏微分方程的图像分割方法一直备受国内外学者的关注,因它拥有传统的
毛白杨(Populus tomentosa)是我国北方重要的乡土树种,主要造林区域在华北和西北地区。这些区域内,季节性干旱(春旱和伏旱)经常发生,有些年份还会有偶发的严重干旱,因此水分胁迫是影响毛白杨人工林林分生长的主要问题之一。叶物候观察到毛白杨在干旱毛白杨在干旱季节可能会出现少许落叶甚至全部落叶,复水后展出新叶或者出现死亡的状况。本研究以毛白杨两个无性系北林雄株一号(P.‘Beilinxion
1907年,日本帝国主义把侵略的魔爪伸到延边地区,延边地区各族人民率先举起反日的大旗,创办了瑞甸书塾、大成中学和东兴中学等以反日文化启蒙为宗旨的学校,开启了反日启蒙运动。十月革命后,马克思主义在延边地区广泛传播,深刻影响了延边地区的青年群体。在马克思主义的影响下,延边地区的青年学生以罢课示威的方式,反对封建、宗教和日本帝国主义对学生思想上的控制,使得延边地区的青年运动有了新的发展。接受了马克思主义
研究背景:《精神疾病诊断与统计手册》(DSM-V)中指出,社会沟通与交往障碍以及重复刻板行为是孤独症谱系障碍(ASD,Autism Spectrum Disorder)的两大核心障碍,目前针对孤独症群体的研究多关注个体的社会性损伤,对重复刻板行为的关注较少,重复刻板行为的发生机制也尚不明确。重复刻板行为会对ASD儿童的社会技能和社会环境融合获得造成严重影响,阻碍ASD儿童功能性行为的发展。已有研究
目的:在过去的25年里,与胶质瘤相关的文献数量大量增加。但是虽然发表的文献数量在增长,胶质瘤依然是最难治疗的肿瘤之一。本研究旨在利用机器学习和文本分析的方法,从已经发表的文献的角度,来分析过去25年来与胶质瘤相关研究的主题概况。方法:在2019年4月,我们下载了1994年至2018年在PubMed检索到的所有与胶质瘤相关的文献,从原始数据集中提取每篇文章的标题、出版日期、MeSH主题词和摘要,以便
树木种内不同地理种群林分的适应性与正常生长具有一定的生态限制,不当的跨生态区调拨种子可导致林分稳定性与生产力降低。外来种质对引入地自然生境与栽培措施的适应性进化对其可持续利用价值有重要影响。20世纪50-80年代北京地区开展了大规模人工造林,油松(Pinus tabuliformis Carr.)是主要的造林树种之一,其种源主要来自油松中心分布区的山西省。这些油松人工林不同林分间在生长与适应性上表