黄淮麦区小麦面粉加工品质相关性状的全基因组关联分析及高分子量谷蛋白亚基组成分析

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小麦面粉加工品质性状是由多基因控制的数量性状,遗传基础较为复杂。利用高密度SNP标记对小麦品系的面粉加工品质相关性状进行关联分析,挖掘其潜在的有益基因位点,为小麦的面粉加工品质改良提供新的基因资源。本研究以178份黄淮麦区小麦品系为材料,在辉县、开封和温室3个不同环境条件下进行田间试验,结合小麦660K SNP芯片上来自A、B、D染色体组上的多态性位点,对小麦的面粉加工品质相关性状进行全基因组关联分析,为小麦品质育种提供优异位点;同时通过SDS-PAGE技术对178份小麦品系进行高分子量谷蛋白亚基(HMW-GS)的鉴定,并与小麦面粉加工品质进行数量回归分析,进而分析HMW-GS与小麦品质性状的关系。全文取得如下结果:(1)对178份黄淮麦区小麦品系的面粉加工品质性状:蛋白含量(GPC)、湿面筋含量(WGC)、吸水率(WA)、粉质延伸度(FE)、沉降值(SV)、稳定时间(ST)进行考察,对三个环境条件下的品质性状进行最优无偏估计,求得每个性状的BLUE值。结果表明:6个品质性状在不同环境下均存在广泛变异,变异系数最大的是稳定时间,为36.07%,最小的是吸水率,为3.23%。双因素方差分析结果显示,6个品质性状基因型、环境以及基因型与环境互作均达到极显著差异(P<0.001)。广义遗传率分析表明湿面筋含量遗传率最大,为76%,蛋白含量遗传率为74%,沉降值遗传率为69%,粉质延伸度遗传率为59%,吸水率与稳定时间的遗传率最小,均为48%。相关性分析结果显示:蛋白含量与湿面筋含量、吸水率、粉质延伸度、沉降值、稳定时间均呈极显著正相关;湿面筋含量与吸水率、粉质延伸度、沉降值、稳定时间均呈极显著正相关;吸水率与粉质延伸度、沉降值呈极显著正相关,与稳定时间呈正相关;粉质延伸度与沉降值、稳定时间呈极显著正相关;沉降值与稳定时间呈极显著正相关。(2)基于小麦660K SNP芯片中来自A、B、D染色体组上的292595个高质量的多态性SNP标记,对178份黄淮麦区小麦品系进行全基因组关联分析,结果表明:在3个不同环境条件下及BLUE值下共鉴定出3613个与面粉加工品质性状显著关联的位点,其中包含303个与品质性状稳定关联的位点,这些SNP位点在小麦的所有染色体上均有分布。与吸水率稳定关联位点最多,为90个,稳定关联区段9个,其中位于6B染色体(496.90-497.71 Mb)上SNP位点较多;检测到与蛋白含量稳定关联位点共51个,稳定关联区段9个,且在1B染色体上检测到的SNP位点最多;检测到与湿面筋含量稳定关联位点共30个,稳定关联区段共2个,分布在1B及5B染色体上;检测到与粉质延伸度稳定关联位点共83个,稳定关联区段共3个,其中1B染色体上定位到的SNP位点最多;检测到与沉降值稳定关联位点共29个,稳定关联区段共3个,其中在5A染色体上定位到的SNP位点最多;检测到与稳定时间稳定关联位点共20个,稳定关联区段共2个,其中位于3A染色体(459.57-461.67 Mb)上的SNP位点较多。另外,对178份优质小麦的相关品质性状关联的SNP位点进行候选基因预测和功能注释,结果表明这些位点在小麦中主要与低分子量谷蛋白、蛋白结构域、转移酶、蛋白激酶、亮氨酸等相关。(3)以178份黄淮麦区小麦品系为材料,通过SDS-PAGE技术对其进行高分子量谷蛋白亚基鉴定,通过HMW-GS与小麦品质性状建立线性回归方程,分析得到Glu-1位点编码的亚基类型对各品质性状的影响效应,结果表明:178份黄淮麦区小麦品系在Glu-1位点上共分离出13种HMW-GS亚基类型及29种亚基组合,(1,7+8,5+10)亚基组合出现频率最大为11.80%,有12种亚基组合仅出现一次频率为0.56%,HMW-GS品质评分范围为5-13分,品质平均评分大于8分。Glu-1位点上各亚基变异对蛋白含量、湿面筋含量、吸水率、粉质延伸度、沉降值、稳定时间的影响效应均为Glu-D1>Glu-B1>Glu-A1。
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