【摘 要】
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目的:肾透明细胞癌（clear cell renal cell carcinoma,ccRCC）是泌尿系肿瘤中最常见的恶性肿瘤之一,而N6-甲基腺苷（m6A）所调节的基因表达和表型已被发现在健康和疾病中均发挥重要作用。在此研究中,我们的目的是构建一个用于预测ccRCC患者预后的,基于m6A相关基因的风险评分（risk score,RS）。方法:我们从癌症基因组图谱（The Cancer Genom
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目的:肾透明细胞癌（clear cell renal cell carcinoma,ccRCC）是泌尿系肿瘤中最常见的恶性肿瘤之一,而N6-甲基腺苷（m6A）所调节的基因表达和表型已被发现在健康和疾病中均发挥重要作用。在此研究中,我们的目的是构建一个用于预测ccRCC患者预后的,基于m6A相关基因的风险评分（risk score,RS）。方法:我们从癌症基因组图谱（The Cancer Genome Atlas,TCGA）数据库中下载数据集TCGA-KIRC,并从其中获取m6A相关基因的基因表达数据以及相对应的ccRCC患者的临床数据。首先我们通过一致性聚类分析来分析m6A相关基因与肾透明细胞癌患者预后的关系。之后从其中提取出在肿瘤组织和正常组织之间具有差异表达的m6A相关基因以及其中对ccRCC患者具有预后意义的基因,并采用最小绝对收缩和选择算子（least absolute shrinkage and selection operator,LASSO）来开发RS模型,随而使用Cox回归分析来预测ccRCC患者的生存率以及分析RS和其他临床指标（如年龄、等级和分期等因素）的关系,从其中筛选出独立预后因子。最后我们将该RS应用于验证集（即来自Arrayexpress数据库的数据集EMTAB-1980）进行进一步验证。以上所有步骤均使用R包在R软件（v 3.5.1）来实现可视化。结果:通过一致性聚类分析,我们将ccRCC患者分为两组,并发现这两组患者的预后具有统计学差异,接着我们基于TCGA数据库中ccRCC患者们的基因表达及临床数据,筛选出相应的预后相关m6A基因,并以此为基础建立了一个包含METTL3、METTL14和HNRNPA2B1的三基因的RS,它成功预测了TCGA中ccRCC患者的总生存期（overall survival,OS）,在将RS与其他临床病理因素一起进行单因素及多因素Cox回归分析之后,我们证实了RS可以作为独立预后因子。最后我们将RS应用到Arrayexpress的验证集中,证实了RS同样适用于预测验证集中ccRCC患者的预后。结论:综上所述,本研究构建了一个由三个m6A相关基因组成的RS,它可以预测ccRCC患者的预后,因此本研究的结果或将有助于未来的研究者们开发新的治疗策略。当然,我们的结果仍需要进一步的实验研究来验证。
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