膳食诱导肥胖大鼠的肠道菌群结构研究

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近十几年以来,肥胖人群的数量增长速度惊人,肥胖及其导致的糖耐量异常、胰岛素抵抗甚至II型糖尿病等一系列代谢性综合症,已经严重影响到了人类的健康水平和生活质量。尽管许多研究表明,某些类型的肥胖可能和基因的突变有关,但是由于在短期内人类的基因型不可能发生重大的改变,所以目前肥胖研究者们已经将注意力集中到导致全球肥胖盛行的可能环境外因上。而作为人类后天获得的“第二基因组”,肠道微生物群落和宿主存在着互惠互利的共生关系;已有研究表明,由于肠道菌群的存在能提高宿主从食物中摄取能量的效率、调控脂肪代谢以及引起低水平的慢性炎症反应,从而导致体重的增加和肥胖的发生。因此,探索肠道微生物与肥胖之间的关系日益成为国际学术界关注的焦点。本研究将同一批远交群SD雄性大鼠随机分成两组,第一组大鼠喂食高脂饲料(HFD),为膳食诱导肥胖(DIO)组;第二组大鼠喂食正常饲料,为对照组。从分组时的零时刻开始每周采集上述两组共13只大鼠的粪便样品,共持续7周。采用ERIC-PCR、群落杂交、实时定量PCR和变性梯度凝胶电泳(DGGE)等分子生态学技术结合主成分分析(PCA)、偏最小二乘分析(PLS)等多变量统计分析方法对造模前后样品的肠道菌群结构进行分析,试图揭示高脂饮食和正常饮食状态下菌群结构的变化和差异,并试图找到能够区分这种差异的关键因素和分子标记。本研究首先利用ERIC-PCR结合群落杂交对膳食诱导肥胖大鼠肠道菌群的结构特征及分子标示物进行了研究。对两组大鼠粪便菌群总DNA进行ERIC-PCR和群落杂交揭示菌群结构的差异,结合多变量统计分析找出造成差异的关键条带,回收并对关键条带测序以鉴定该序列在系统发育上最接近的微生物物种,最后针对该片段的序列设计特异性引物进行荧光定量PCR对上述结果进行验证。结果发现高脂膳食组大鼠的肠道菌群结构与对照组有着显著的差异;找到了一种仅仅出现在高脂膳食组的序列,这一特异序列可作为膳食诱导肥胖大鼠肠道菌群的分子标记物。本研究还对膳食诱导肥胖大鼠肠道菌群中的双歧杆菌类群进行了研究。通过双歧杆菌类群特异PCR-DGGE技术阐明两组之间双歧杆菌类群种类的差异,利用荧光实时定量PCR技术对两组间双歧杆菌数量的差异进行比较,最后回收并对差异条带进行测序,确定其系统分类地位。结果发现两组之间的双歧杆菌类群组成结构上存在差异,鉴定出一条主要的差异条带与Bifidobacterium minimum存在着100%的相似性,提示这种细菌可能与肥胖有一定的关系。通过上述研究,揭示了膳食诱导肥胖大鼠的肠道菌群结构与正常大鼠存在的差别,找到了一种肥胖大鼠的特异基因片段;分析了双歧杆菌类群组成结构上的差异,鉴定出一种导致两组之间差异的双歧杆菌。这些结果对理解肥胖与宿主微生物肠道菌群之间的关系具有一定的参考价值。
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