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目的:
本研究通过对急性早幼粒细胞白血病(APL)患者治疗前后的骨髓配对标本进行miRNA芯片检测,筛选出差异表达的miR-638;基于TaqMan探针的实时荧光RT-PCR方法检测miR-638表达水平,分析miR-638在体外诱导的APL细胞系中的表达规律;对不同白血病标本进行miR-638表达水平检测,分析评价miR-638表达水平在APL的辅助诊断、治疗及复发监测中的临床应用价值。方法:
1.APL患者治疗前后差异miRNAs的筛选与实时荧光RT-PCR验证
收集APL患者治疗前后的骨髓配对标本,进行miRNA芯片检测,对基因芯片表达谱分析得出的差异表达miR-638并用实时荧光RT-PCR法进行验证。
2.检测miR-638在不同髓系白血病细胞系中的表达
细胞水平验证体外诱导APL细胞系中miR-638的表达规律,用NB4和HL-60细胞作为诱导分化模型,加入ATRA药物后分析miR-638表达水平。采用流式细胞术检测ATRA诱导下NB4细胞的髓样特异性表面标志物CD11b表达。3.评价miR-638表达水平在APL诊疗中的应用价值
(1)评价骨髓miR-638表达水平在APL辅助诊断中的价值
分别对30例初诊APL患者、初诊AML患者及正常对照骨髓标本进行实时荧光RT-PCR检测,采用ROC曲线分析miR-638的诊断性能。
(2)评价骨髓miR-638表达水平在APL患者治疗反应和复发监测中的价值
分别对30例APL患者初诊与诱导治疗后的骨髓标本进行miR-638表达水平检测;同时对4例APL复发患者的骨髓标本进行miR-638表达水平检测。
(3)评价miR-638表达水平在APL患者微小残留病(MRD)及治疗监测中的价值
对30例APL患者诱导治疗前后配对骨髓标本进行MRD检测,并进行相关性分析。同时收集诱导治疗前后APL患者外周血样本进行miR-638表达水平检测,与骨髓miR-638进行相关性分析。
结果:
1.APL患者治疗前后骨髓基因芯片分析与实时荧光RT-PCR验证结果
通过火山图对芯片数据进行过滤,确定了APL患者骨髓标本中差异表达的miRNAs。经过筛选,发现有5个miRNAs下调,25个上调。在25个上调的miRNAs中,miR-638显著上调。对包括miR-638在内的候选miRNAs进行实时荧光RT-PCR验证,结果完全符合。
2.体外诱导APL细胞系中miR-638的表达规律
与非APL细胞系(U937、THP-1、K562、Kasumi-6、HEL)相比,miR-638在HL-60、NB4等APL细胞系中显著下调,差异有统计学意义(P<0.01);随着作用时间延长,ATRA处理后HL-60细胞和NB4细胞miR-638表达上调(P<0.05),这与CD11b表达上调相一致。
3.miR-638表达水平在APL诊疗中的应用价值
(1)骨髓miR-638表达水平在APL辅助诊断中的价值
与正常对照组相比,APL患者骨髓miR-638显著下调(P<0.01),miR-638在AML患者中表达降低,有统计学差异(P<0.01);ROC曲线分析表明,当cut off值为3.025时,ROC曲线下面积(AUC)为0.9602。
(2)骨髓miR-638表达水平在APL治疗反应和复发中的价值
骨髓miR-638表达水平在初诊APL患者中表达较低,在诱导治疗和完全缓解后(CR)表达明显升高,差异具有统计学意义(P<0.01),诱导治疗后组与CR组miR-638表达水平无显著性差异(P>0.05)。APL复发患者miR-638表达下调,但仍高于APL初诊患者miR-638表达水平,差异具有统计学意义(P<0.01)。
(3)miR-638表达水平在APL患者MRD及治疗监测中的价值
在APL初诊患者中,骨髓miR-638表达水平与PML-RARα表达呈负相关(r=0.800,P<0.01)。在APL诱导分化后,骨髓miR-638表达水平也与PML-RARα表达呈负相关(r=0.500,P<0.01)。骨髓miR-638的表达也与MRD监测结果呈负相关。外周血与骨髓miR-638表达水平呈正相关(r=0.982,P<0.01)。
结论:
1.骨髓miRNA表达谱分析筛选出差异表达的miR-638,经实时荧光RT-PCR方法验证,结果完全符合。
2.miR-638在NB4细胞中存在低表达,诱导分化后表达上升。
3.骨髓miR-638在初诊、完全缓解和复发APL患者中的存在差异表达,骨髓miR-638表达水平上调反映了APL患者的治疗反应,骨髓miR-638表达水平可能作为APL辅助诊断的指标。
4.骨髓miR-638表达水平与PML-RARα、MRD监测结果均呈负相关,骨髓miR-638可能作为MRD监测指标;外周血与骨髓miR-638表达水平呈显著正相关,外周血miR-638表达水平可能作为治疗监测指标。
本研究通过对急性早幼粒细胞白血病(APL)患者治疗前后的骨髓配对标本进行miRNA芯片检测,筛选出差异表达的miR-638;基于TaqMan探针的实时荧光RT-PCR方法检测miR-638表达水平,分析miR-638在体外诱导的APL细胞系中的表达规律;对不同白血病标本进行miR-638表达水平检测,分析评价miR-638表达水平在APL的辅助诊断、治疗及复发监测中的临床应用价值。方法:
1.APL患者治疗前后差异miRNAs的筛选与实时荧光RT-PCR验证
收集APL患者治疗前后的骨髓配对标本,进行miRNA芯片检测,对基因芯片表达谱分析得出的差异表达miR-638并用实时荧光RT-PCR法进行验证。
2.检测miR-638在不同髓系白血病细胞系中的表达
细胞水平验证体外诱导APL细胞系中miR-638的表达规律,用NB4和HL-60细胞作为诱导分化模型,加入ATRA药物后分析miR-638表达水平。采用流式细胞术检测ATRA诱导下NB4细胞的髓样特异性表面标志物CD11b表达。3.评价miR-638表达水平在APL诊疗中的应用价值
(1)评价骨髓miR-638表达水平在APL辅助诊断中的价值
分别对30例初诊APL患者、初诊AML患者及正常对照骨髓标本进行实时荧光RT-PCR检测,采用ROC曲线分析miR-638的诊断性能。
(2)评价骨髓miR-638表达水平在APL患者治疗反应和复发监测中的价值
分别对30例APL患者初诊与诱导治疗后的骨髓标本进行miR-638表达水平检测;同时对4例APL复发患者的骨髓标本进行miR-638表达水平检测。
(3)评价miR-638表达水平在APL患者微小残留病(MRD)及治疗监测中的价值
对30例APL患者诱导治疗前后配对骨髓标本进行MRD检测,并进行相关性分析。同时收集诱导治疗前后APL患者外周血样本进行miR-638表达水平检测,与骨髓miR-638进行相关性分析。
结果:
1.APL患者治疗前后骨髓基因芯片分析与实时荧光RT-PCR验证结果
通过火山图对芯片数据进行过滤,确定了APL患者骨髓标本中差异表达的miRNAs。经过筛选,发现有5个miRNAs下调,25个上调。在25个上调的miRNAs中,miR-638显著上调。对包括miR-638在内的候选miRNAs进行实时荧光RT-PCR验证,结果完全符合。
2.体外诱导APL细胞系中miR-638的表达规律
与非APL细胞系(U937、THP-1、K562、Kasumi-6、HEL)相比,miR-638在HL-60、NB4等APL细胞系中显著下调,差异有统计学意义(P<0.01);随着作用时间延长,ATRA处理后HL-60细胞和NB4细胞miR-638表达上调(P<0.05),这与CD11b表达上调相一致。
3.miR-638表达水平在APL诊疗中的应用价值
(1)骨髓miR-638表达水平在APL辅助诊断中的价值
与正常对照组相比,APL患者骨髓miR-638显著下调(P<0.01),miR-638在AML患者中表达降低,有统计学差异(P<0.01);ROC曲线分析表明,当cut off值为3.025时,ROC曲线下面积(AUC)为0.9602。
(2)骨髓miR-638表达水平在APL治疗反应和复发中的价值
骨髓miR-638表达水平在初诊APL患者中表达较低,在诱导治疗和完全缓解后(CR)表达明显升高,差异具有统计学意义(P<0.01),诱导治疗后组与CR组miR-638表达水平无显著性差异(P>0.05)。APL复发患者miR-638表达下调,但仍高于APL初诊患者miR-638表达水平,差异具有统计学意义(P<0.01)。
(3)miR-638表达水平在APL患者MRD及治疗监测中的价值
在APL初诊患者中,骨髓miR-638表达水平与PML-RARα表达呈负相关(r=0.800,P<0.01)。在APL诱导分化后,骨髓miR-638表达水平也与PML-RARα表达呈负相关(r=0.500,P<0.01)。骨髓miR-638的表达也与MRD监测结果呈负相关。外周血与骨髓miR-638表达水平呈正相关(r=0.982,P<0.01)。
结论:
1.骨髓miRNA表达谱分析筛选出差异表达的miR-638,经实时荧光RT-PCR方法验证,结果完全符合。
2.miR-638在NB4细胞中存在低表达,诱导分化后表达上升。
3.骨髓miR-638在初诊、完全缓解和复发APL患者中的存在差异表达,骨髓miR-638表达水平上调反映了APL患者的治疗反应,骨髓miR-638表达水平可能作为APL辅助诊断的指标。
4.骨髓miR-638表达水平与PML-RARα、MRD监测结果均呈负相关,骨髓miR-638可能作为MRD监测指标;外周血与骨髓miR-638表达水平呈显著正相关,外周血miR-638表达水平可能作为治疗监测指标。