内生真菌Alternaria oxytropis OW7.8 swnK基因克隆及功能研究

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小花棘豆(Oxytropis glabra)是一种含有毒生物碱—苦马豆素(swainsonine,SW)的植物,其内生真菌产SW,导致宿主植物中SW积累表现出毒性,课题组从小花棘豆中分离了产SW的内生真菌Alternaria oxytropis。前人研究发现产SW内生真菌还有豆类丝核菌(Slafractonia leguminicola)、罗伯茨绿僵菌(Metarhizium robertsii)、金龟子绿僵菌(Metarhizium anisopliae)等。在真菌的SW合成途径研究中,发现有一个共同的SWN基因簇,其中swn K是一个关键基因,推测其编码一个多功能蛋白,含七个结构域:A结构域进行腺苷酰化、T结构域进行硫醇化、KS结构域编码酮基合酶、AT结构域编码酰基转移酶、KR结构域编码聚酮还原酶、ACP结构域编码酰基载体蛋白、R结构域编码还原酶,经多步反应,催化哌啶酸生成1-羟基-吲哚里西啶。本研究利用PCR技术克隆SW合成途径中关键基因swn K及其启动子区,进行生物信息学分析,构建swn K基因ACP结构域和R结构域的敲除载体,将其转化A.oxytropis OW7.8原生质体,筛选基因敲除转化子,并检测其SW水平,为明晰A.oxytropis的SW合成分子机制及代谢途径提供基础数据,结果如下:1.克隆了A.oxytropis OW7.8 swn K基因,从ATG-TAA共有7515bp,无内含子,编码2504个氨基酸,含7个结构域:A结构域168bp-1578bp(腺苷酰化作用);T结构域1647bp-1833bp(磷酸泛酰巯基乙胺连接物位点);AT/KS结构域1899bp-4557bp(聚酮合酶);KR结构域4599bp-5961bp(β-酮酰还原酶);ACP结构域6024bp-6270bp(磷酸泛酰巯基乙胺连接物位点);R结构域6453bp-7338bp(α-氨基己二酸还原酶Lys2和NRPSs的硫酯还原酶结构域)。2.克隆了swn K基因上游调控区,包括启动子、增强子、光响应元件、缺氧特异性诱导元件,其中-52bp至-57bp为TATA-box、-81bp至-85bp为CAAT box、-158bp至-163bp为G-box、-186bp至-191bp为CCAAT-box等,共计有1个TATA-box、4个CAAT-box、1个G-box。3.构建了swn K基因ACP结构域敲除载体(5568bp)和R结构域敲除载体(5224bp),含其结构域上游DNA同源区序列+hph+下游DNA同源区序列、ampr,是大肠杆菌-丝状真菌的穿梭载体;构建了swn K基因R结构域编辑载体(16510bp),含靶位点、ampr、hph、gpd A启动子、trp C终止子,也是大肠杆菌-丝状真菌的穿梭载体。4.利用PEG介导,将swn K基因敲除载体转化A.oxytropis OW7.8原生质体,筛选出swn K基因ACP结构域敲除突变株ΔACP1和ΔACP2,培养20d的ΔACP1和ΔACP2菌丝体中未测出SW,相同条件下培养的野生型菌株OW7.8菌丝中SW水平为5.072mg/g。推测Swn K失去ACP结构域功能后,底物Malonyl-Co A无法结合,Malonyl-Co A与哌啶酸不能缩合生成1-羟基-吲哚里西啶,后续SW则无法合成,故敲除株中不含SW。5.敲除株ΔACP1和ΔACP2菌落形态与野生型有所不同,表现为菌落形状不规则、边缘非整齐、呈乳白色、辐射状生长、背面无色素积累。
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