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杂种优势是自然界普遍存在的一种生物学现象,而且在农业生产上得到了广泛的应用。大白菜是杂种优势显著、自交容易衰退的十字花科蔬菜。本研究进行了96份大白菜自交系的基于Indel标记遗传多样性分析和基于农艺性状遗传多样分析、配合力分析、大白菜杂交组合间优势度鉴定、四个优势相关基因在不同优势度组合中表达量分析,取得以下结论:(1)基于Indel标记的遗传多样性分析,发现大白菜自交系间的遗传距离为0.3333~0.8333,平均值为0.5884。以遗传距离0.52为标准,将96份大白菜自交系分为了六大类,第一类群包含了21份材料,第二份类群包含了12份材料,第三类群包含了16份材料,第四类群包含了15份材料,第五类群包含了14份材料,第六类群包含了18份材料。(2)基于农艺性状遗传多样性分析发现亲本之间16个农艺性状的变异系数较大,在欧式距离为5时能将78份大白菜自交系划分为6大类群。第一大类包含19份材料,第二大类包含8份材料,第三大类包含24份材料,第四大类包含16份材料,第五大类包含3份材料,第六大类包含8份材料。(3)通过对大白菜杂交组合间优势度鉴定分析,发现杂种一代中除了短缩茎长度和叶球高之外,其他所有性状的平均值全部高于亲本性状的平均值。对129份杂交组合杂种优势分析发现,在超中优势中除了叶球高和短缩茎长度外,其它性状都是正向优势组合数大于负向优势组合数。(4)对14个亲本配合力分析,确定A75、A17-1、A218、A51-4、油三和A222的一般配合力较高。组合A54-1×C30、A84-1-1-1×A230双亲一般配合力效应值相对较小,但它们的特殊配合力效应值较大,而组合A51-4×A17-1双亲一般配合力效应值相对较大,但是它们的特殊配合力效应值较小。(5)基于Indel标记的遗传距离划分的六大类群中,第一大类群与第四大类群相互杂交相比于其它群相互杂交具有优势;基于农艺性状遗传距离划分的六大类群中,第一大类群与第三大类群相互杂交相比于其它群相互杂交具有优势。(6)综合超中优势、超亲优势、超标优势三个优势指标分析,发现油三×A17-1、A66-2-1×A17-1、A51-4×C15-111-1、A222×C15-111-1、A209-1×A17-1、A118×A75相比于其它组合具有较强的杂种优势。(7)通过对BrDDM1、BrCCA1、BrTOC1、BrLHY四个优势相关基因在不同优势度组合中表达量分析发现,BrDDM1和BrLHY基因表达量与优势度成正相关。