21世纪初期以来,山东省乡镇畜牧兽医站与畜牧合作社之间的关系发生了深刻的变革。本文通过实证分析和理论分析相结合的方法,理清了21世纪初期以来乡镇畜牧兽医站与畜牧合作社关系变革的脉络,提出了改革后山东省乡镇畜牧兽医站与畜牧合作社实现双赢的发展模式。2001年—2006年上半年,在山东省乡镇畜牧兽医站减负式改革与农民合作需求契合的背景下,乡镇畜牧兽医站参与发展畜牧合作社,既促进了畜牧合作社的发展;又促进了乡镇畜牧兽医站的发展。2006年下半年以来,在新一轮乡镇畜牧兽医站改革和《中华人民共和国农民专业合作社法》出台的新政策指导下,山东省乡镇畜牧兽医站与畜牧合作社的关系面临强制性制度变迁,乡镇畜牧兽医站作为公益性事业单位,不能再作为成员加入畜牧合作社,乡镇畜牧兽医站与畜牧合作社必须“站社分离”。但是,乡镇畜牧兽医站与畜牧合作社从自身的需要和共同的目标出发,仍然应建立相互促进、共同发展的关系,只有合作,才能共赢。乡镇畜牧兽医站与畜牧合作社关系的重建,主要从畜牧合作社促进乡镇畜牧兽医站履行职责、乡镇畜牧兽医站推动畜牧合作社发展两个方面实现合作共赢。