自19世纪科学技术进入高速发展的历史阶段后,科技对经济发展的影响力不断提升,与经济发展和人民生活质量的联系日益紧密,并越来越得到各国政府的重视。以知识为基础的新经济时代,原始性创新能力已成为国家科技经济竞争的重要焦点之一。我国国家实验室建设才刚刚开始起步,深入研究国家实验室的管理体制和运行机制,有助于吸收国外先进管理经验,形成适合我国国情的管理模式和运行机制,进一步推动我国国家实验室的建设。作者在对国内外相关文献进行广泛的分析和研究的基础上,详细分析了美、欧、亚洲的国家实验室的管理模式和运行机制,把我国国家实验室的管理模式与和国外的相比,进行对比研究,对我国国家实验室建设中需要改进的方面进行了阐述。最后是应用研究,本文对西南交通大学轨道交通国家实验室(筹)的建设情况作为实证进行分析,结合上文,对构建轨道交通国家实验室的管理体制、组织结构与运行机制提出若干建议。