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秦艽属于龙胆科(Gentianaceae)龙胆属秦艽组(Gentiana sect. Cruciata)的草本植物。在《中华人民共和国药典》(2005版)中规定了大叶秦艽(G. macrophylla Pall.)、粗茎秦艽(G crassicaulis Duthie.)、小秦艽(G dahurica Fisch.)和麻花艽(G.straminea Maxim.)作为四个类别正品的原植物。大叶秦艽(G. macrophylla)在这四个种类里是最主要的一类。关于秦艽的药学应用和它的历史渊源由来已久。根据相关报道记载它的道地产区包括有陕西黄土高原腹地以及甘肃省的部分地区。秦艽组植物有很好的药用疗效,在中国传统医药学中发挥着很显著的作用,例如风湿痹痛和关节疼痛还有结核病、黄疸等等都是秦艽的主要疗效。由于过度采挖导致野生秦艽资源匮乏,秦艽已被列为我国三类重点保护植物。本研究以上述4种国家药典收录的秦艽组植物为研究对象,应用叶绿体基因和核基因序列数据,对其谱系地理结构、遗传多样性及物种和种群分化等进行研究,研究成果可为进一步地探讨和阐释4种秦艽组植物物种形成历史、物种间基因交流与分化机制以及制定科学合理的保护策略提供有意义的参考。本文用于4种秦艽组植物的分析材料共有28个居群265个体,用叶绿体(母系遗传)trnMV片段和核ITS(双亲遗传,Internal Transcribed Spacer)片段作为分子标记,对居群样品进行测序分析。trnMV片段分析检测到7种单倍型(Haplotype),即H1-H7,分成比较明显的三支：其中Hl、H2、H5、H6为一支,四种单倍型加起来在秦艽组植物中都有所出现；H7单独成一支,分布在粗茎秦艽(G. crassicaulis)中；H3、H4形成第三支,其中的所有个体都属于大叶秦艽(G. macrophylla)。核ITS的片段测序分析检测得到12种ITS类型,即g1-g12,分成了四支。其中g3-g8为一支,所有的都分布在大叶秦艽(G macrophylla)中；g1出现在麻花艽(Gstraminea)和粗茎秦艽(G crassicaulis)之中；g2只分布于麻花艽(G straminea)中；g9、g11只分布于小秦艽之(G. dahurica)中；g10分布于小秦艽(G. dahurica)和粗茎秦艽(G. crassicaulis)之中；g12只分布于粗茎秦艽(G. crassicaulis)之中。通过AMOVA分析,结果表明遗传变异主要存在于居群之间,占总体的97.9%,居群内部的变异只有0.81%；Fst值显著,达0.99193,显示种内居群之间的遗传分化程度很大,总体遗传多样性较低。四个种之间的变异也只有1.29%。表明秦艽组四个物种之间仅存在极有限的基因流。叶绿体单倍型和ITS类型在种间的重叠说明几种秦艽组植物存在基因共享现象,这可能是古基因流或古杂交事件介导的基因渐渗的结果。